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鼠轮状病毒荧光定量PCR检测方法的建立及初步应用

2017-11-13蔡骁垚孙竹筠陈懿斐林颖峥李泽君魏晓锋陈鸿军

中国动物传染病学报 2017年5期
关键词:小鼠检测方法

蔡骁垚,孙竹筠,熊 炜,陈懿斐,林颖峥,张 泉,李泽君,魏晓锋,陈鸿军

(1.中国农业科学院上海兽医研究所,上海200241;2.扬州大学兽医学院,扬州225009;3.上海实验动物研究中心,上海201203;4.上海出入境检验检疫局,上海200135)

鼠轮状病毒荧光定量PCR检测方法的建立及初步应用

蔡骁垚1,2,孙竹筠1,熊 炜3,陈懿斐4,林颖峥3,张 泉2,李泽君1,魏晓锋4,陈鸿军1

(1.中国农业科学院上海兽医研究所,上海200241;2.扬州大学兽医学院,扬州225009;3.上海实验动物研究中心,上海201203;4.上海出入境检验检疫局,上海200135)

根据鼠轮状病毒(Murine rotavirus, MRV)EB-C8/G16P毒株VP1基因(GenBank登录号:KJ477127.1),设计引物和TaqMan探针,确定标准曲线,建立MRV荧光定量PCR方法,检测其特异性、敏感性和稳定性。结果显示,建立的MRV荧光定量PCR方法标准曲线的线性关系良好,R2值可达0.99;最低可检测到10 copies/μL,是常规PCR的100倍;与常见的小鼠病毒株均无特异性扩增;批内和批间变异系数均小于2%,表明该方法重复性好。将建立的荧光定量PCR初步对246份小鼠肠道样品病料进行检测,结果均为阴性。本研究建立的MRV荧光定量PCR方法特异性、灵敏性良好,可为鼠轮状病毒的流行病学调查、检测以及制定国家标准和地方标准提供可靠的数据和适用的监测方法。

鼠轮状病毒;TaqMan;荧光定量PCR

鼠轮状病毒(Murine rotavirus,MRV)为双股RNA病毒,在小鼠中普遍存在,可造成乳鼠流行性腹泻(epidemic diarrhea of mice,EDIM)。我国开放饲养的小鼠中EDIM发生率很高[1]。MRV属呼肠孤病毒科、轮状病毒属,外壳具有区别于其他轮状病毒的特异性抗原。MRV属于A组轮状病毒,与婴幼儿的轮状病毒有交叉反应,而与乳大鼠的B组轮状病毒没有交叉反应,所以MRV只引起乳小鼠的发病。……

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