黄涛 于千

摘要：对已公布数据库中的33种藻类的336条HSP90蛋白提交记录进行筛选，得到43条长度在546-906个氨基酸之间的HSP90蛋白序列，采用生物信息学手段对HSP90家族的蛋白结構，包括：保守结构域、跨膜区，信号肽、导肽和保守基序进行了分析。

关键词：藻类；热休克蛋白家族；蛋白结构；生物信息学分析

【中图分类号】Q811【文献标识码】A【文章编号】2236-1879（2017）12-0274-01

热休克蛋白（HSPs）又称为热激蛋白，作为一类对体内外环境变化极为敏感的蛋白分子广泛参与各种生理生化代谢途径，是近年来抗逆生物学研究领域中较为活跃且发展较快的领域之一[1-3]。

藻类植物属于较低等的植物类群，包括原核藻类和真核藻类，本研究中对藻类HSP90蛋白的结构和分子系统发育分析能为藻类大分子量热休克蛋白研究提供理论基础。另外，近年来备受关注的热休克蛋白也成功地应用于分子系统学的研究，在原核细胞领域，热休克蛋白HSP65的基因序列已有效的反映出了不同分支杆菌间的亲缘关系，其结果可与16SrDNA的分析结果相媲美[4]。

1材料与方法

1.1蛋白序列的获得：

数据资料来源于NCBI的蛋白质数据库。关键词为：“heatshockprotein90ANDalgae”或“HSP90ANDalgae”进行搜索。共检索到33种藻类，336条HSP90蛋白提交记录。对这些蛋白序列下载到本地后通过人工和软件筛选，去除重复记录和长度不足500bp的序列后，共得到43条长度在546-906个氨基酸之间的HSP90蛋白序列。

1.2HSPs蛋白序列结构分析：

对获得的氨基酸序列分别进行下列分析：在NCBI提供的CDD数据库进行蛋白功能结构域分析；利用expasytool工具进行蛋白一致性模式序列查找；……