于千 黄涛

摘 要： 对Genbank数据库中的43条长度在546-906个氨基酸之间的HSP90蛋白序列，采用生物信息学手段对HSP90家族蛋白序列标识和保守基序进行了分析，并结合这些信息对这些蛋白进行了分子系统发育分析表明：藻类HSP90蛋白高度保守，家族内可以分为几个亚家族，亚家族内既有原核又有真核藻类HSP90蛋白序列。

关键词： 藻类热休克蛋白；HSP90；系统发育

【中图分类号】 Q51 【文献标识码】 A 【文章编号】 2236-1879（2017）12-0013-01

大多数热休克蛋白的研究是以微生物、动物材料为主，关于植物热休克蛋白反应的研究起步较晚，80年代初期才开始研究高等植物中的热休克蛋白[1]。HSP90蛋白存在于从低等的原核藻类到陆生高等的植物中，在高等植物中，有些HSP90在常温下即有较高的表达，有些需要热激诱导产生，此外，低温、光照和高盐胁迫亦能使其高表达[2]。因此，以HSP90蛋白作为贯穿原核藻类到真核藻类间的纽带，除了可以了解原核藻类与真核藻类HSP90家族间的进化关系，也能为进一步探索HSP90蛋白在藻类中的分子系统学的研究提供有价值的参考依据。

1 材料与方法

1.1 蛋白序列的获得：

数据资料来源于NCBI的蛋白质数据库。共检索到33种藻类的336条HSP90蛋白提交记录。对这些蛋白序列下载到本地后通过人工和软件筛选，去除重复记录和长度不足500bp的序列后，共得到43条长度在546-906个氨基酸之间的HSP90蛋白序列。

1.2 HSPs蛋白序列结构分析：

蛋白序列标识的绘制和分析在网站上完成；运用MEME程序分析基因家族的氨基酸保守基序，程序在设置上选择做大的基序数为50，不同的基序数为15，其它均采用默认的参数；……