基于线粒体基因的广西变色树蜥种群分子系统关系与遗传多样性
2017-10-13韦筱媚刘凡颜琳妙潘亚姐张月云赵成坚徐永莉李力黄勇
韦筱媚, 刘凡, 颜琳妙, 潘亚姐, 张月云, 赵成坚, 徐永莉, 李力, 黄勇*
(1. 广西壮族自治区药用植物园,南宁530023; 2. 广西动力技工学校,南宁530023; 3. 广西师范学院,南宁530001)
基于线粒体基因的广西变色树蜥种群分子系统关系与遗传多样性
韦筱媚1, 刘凡1, 颜琳妙2, 潘亚姐3, 张月云1, 赵成坚1, 徐永莉1, 李力1, 黄勇1*
(1. 广西壮族自治区药用植物园,南宁530023; 2. 广西动力技工学校,南宁530023; 3. 广西师范学院,南宁530001)
物种分子系统关系是进化生物学领域最基本也是最重要的问题之一。本研究通过测序分析了来自广西等地90个变色树蜥Calotesversicolor的ND2-tRNA基因片段,分析了不同地理种群的单倍型、种群间的遗传分化程度(Fst)和历史动态,构建了单倍型之间的分子系统关系。结果发现,所研究的地理种群共检测到45个单倍型,总体呈现较高的单倍型多样性(0.941 8)和较低的核苷酸多样性(0.005 5),其中有6个地理种群的个体共享1个单倍型。大部分种群间Fst值较高且差异显著,遗传分化程度较高。分子方差分析结果表明,遗传变异主要来自种群内的遗传差异。系统进化分析结果表明,所研究的地理种群并没有出现明显的遗传分支且在地理上没有严格的分布范围和分化,这可能是由于种群间存在渐渗杂交或不完全的谱系筛选。网络关系图也显示各采样种群间不存在明显的谱系结构。种群历史动态分析表明,各地理种群不存在扩张现象。把所有地理种群合并在一起分析表明,贝叶斯轮廓图分析与碱基错配分析方法均检测到种群在历史上发生过快速扩张,约0.05 Ma前存在种群扩张现象。……
