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紫花苜蓿bZIP基因家族的鉴定、进化及表达分析

2017-09-08张正社闵学阳孙启忠刘文献

草业科学 2017年8期
关键词:功能分析

齐 晓,张正社,闵学阳,孙启忠,刘文献

(1.中国农业科学院草原研究所,内蒙古 呼和浩特 010010;2.全国畜牧总站 全国草品种审定委员会办公室,北京 100125;3.草地农业生态系统国家重点实验室 兰州大学草地农业科技学院,甘肃 兰州 730020)

紫花苜蓿bZIP基因家族的鉴定、进化及表达分析

齐 晓1,2,张正社3,闵学阳3,孙启忠1,刘文献3

(1.中国农业科学院草原研究所,内蒙古 呼和浩特 010010;2.全国畜牧总站 全国草品种审定委员会办公室,北京 100125;3.草地农业生态系统国家重点实验室 兰州大学草地农业科技学院,甘肃 兰州 730020)

碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子是真核生物转录因子中分布最广泛、最保守的一类蛋白。目前在许多植物中已发现大量的bZIP转录因子,这些bZIP转录因子成员广泛参与种子贮藏基因的表达、植物的生长发育、光信号传导、病害防御、生物和非生物胁迫应答以及ABA的敏感性等各种信号的反应。本研究首次从紫花苜蓿(Medicagosativa)全转录组水平鉴定出bZIP转录因子家族共包含138个基因,根据bZIP蛋白序列进行系统进化分析可以将其分为10类;对MsbZIP基因的系统进化分析表明该基因家族在分类上有很高的保守性。该转录因子家族的基因密码子偏好性分析表明,MsbZIP基因密码子偏好使用A/T碱基。此外,MsbZIP基因GO功能注释分析结果显示,138个MsbZIP基因最终分为23个GO分类,总体包括分子功能和生物学过程两类。相关性分析结果表明,共有372对基因表达相关性极显著(P<0.01)。本研究可为紫花苜蓿bZIP转录因子功能特性、进化历程和生物功能的深入研究奠定基础。

bZIP转录因子;紫花苜蓿;系统进化分析;密码子偏好性

转录因子对植物众多重要的生物学过程起关键性调控作用[1-2]。……

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