基于ITS标记分析安徽省桑种质资源的亲缘关系
2017-08-29王钰婷李瑞雪孙帆王伟汪泰
王钰婷++李瑞雪++孙帆++王伟++汪泰初
摘 要 核糖体DNA内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)是被子植物分子系统发育研究中应用最广泛的分子标记。对收集的12份安徽地方特色桑种质资源提取总DNA,用PCR扩增方法进行测序分析;根据鲁桑基因序列,确定ITS序列范围,并进行序列比对;通过分析序列长度、G+C含量、变异位点及遗传分歧,探讨了安徽桑树种质材料间的亲缘关系,为更深入地研究桑属植物间的系统进化关系提供重要的参考资料。
关键词 桑树种质资源 ;ITS序列 ;进化分析
中图分类号 Q341
An Analysis on Genetic Relationship of Mulberry Germplasm Resources
Collected in Anhui Province Based on ITS Marker
WANG Yuting LI Ruixue SUN Fan WANG Wei WANG Taichu
(Sericultural Research Institute,Anhui Academy of Agricultural Science,Hefei,Anhui 230061)
Abstract Ribosome transcribed spacer(ITS)is the most widely used nuclear DNA sequence in molecular systems. The sequencing analysis was carried out by using the total DNA extraction and PCR amplification method. According to the sequence of Morus multicaulis gene,the ITS sequence range was determined and sequence alignment was performed. By analyzing the sequence length,G + C content and mutation loci and genetic divergence,the phylogenetic relationship between the collected mulberry germplasm in Anhui Province was discussed, which provided the basic reference for the further study of phylogenetic evolution between mulberry plants.
Key words Mulberry germplasm resources ;ITS marker ;phylogeny
桑属(Morus)为桑科的模式属,由Linne(1753)建立。桑树自然杂交普遍,形态学上种间界限相对模糊,属内种数、系统发育关系历来存在较大争议,因而在分子系统学中分类十分困难。从20世纪90 年代起,利用随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)技术围绕桑属植物的亲缘关系及系统进化等开展了一系列的研究[1-2]。进一步研究发现,核糖体内转录间隔区(intergenic transcribed spacer,ITS)序列是核基因组中进化较快的DNA片段,遗传信息位点十分丰富。
核糖体内转录间隔区(ITS)位于核糖体基因中18S、26S之间,是被5.8S分隔开的2段DNA片段[3],分别为ITS1和ITS2(图1)。在被子植物基因组中,ITS序列是高度重复的串联序列,由于没有加入成熟核糖体,选择压力小,进化速度快,而其相对长度又具有保守性,适宜于对低分类群进行系统发育分析[4-6],能够满足探讨属内种间和较近的族间、属间系统发育关系的要求[7-8],已经逐渐成为被子植物亲缘关系及系统进化分析的重要工具[9]。向仲怀等[10]于1995年应用RAPD分子标记,最早开展对桑属分子系统学的研究,获得了桑属9个种的DNA多态性指纹图谱,得到了系统树状图。……
