鸡miR NA的研究进展*
2017-08-22周艳曹顶国
周艳,曹顶国
(山东省农业科学院家禽研究所,山东省家禽育种工程技术研究中心,山东济南250023)
鸡miR NA的研究进展*
周艳,曹顶国**
(山东省农业科学院家禽研究所,山东省家禽育种工程技术研究中心,山东济南250023)
miRNA(microRNA)是一类非编码的、长度约为21~26nt的单链小分子RNA。miRNA广泛存在于真核生物中,序列特异、高度保守。近来研究发现,miRNA广泛参与有机体各个生物学过程,本文就miRNA的发现、作用机制以及在鸡生长发育、生殖以及疫病中的研究进展进行综述。
1 miRNA发现
1993年,VictorAmbros,ColleaguesRosalind Lee和Rhonda Feinbaum首次在线虫中发现lin-4,其产生2个小RNA转录本。一个转录本长度约22nt,另外一个约61nt。通过与Lin-14基因3' UTR的互补序列结合从而调控lin-14的表达[1-2]。Reinhart BJ.等(2000)在线虫中发现let-7编码21核苷酸RNA,并且在lin-14、lin-28、lin-41、lin-42 and daf-12基因3'UTR有互补元件,同lin-4一样对线虫发育具有时空调节作用[3]。随后Lagos-Quintana等[4]Lau等[5]、Lee and Ambros[6]于2001年分别发表了在果蝇、人和蠕虫中发现的大约20个、30个和60个大量表达的、类似lin-4和let-7长度的小RNAs,称之为microRNA(miRNA)。
现代分子技术尤其是高通量测序技术的出现以及生物信息学的发展,为miRNA的研究提供了前所未有的平台,大量的成熟miRNAs和前体小RNA被鉴定出来。2014年6月,miRBase数据库正式发布了21.0版本,包含223个物种的35828条成熟miRNA信息。与20.0版本相比更新了大量的数据,miRNAs发夹前体序列新增4196条,成熟miRNAs新增5441条,包括17个物种的第一个miRNAs。169条发夹前体序列和353条成熟序列更新名称。72条错误注释和重复序列被删除。其中鸡[Gallus gallus]发夹前体miRNAs序列达740条,成熟miRNAs序列994条,部分物种的miRNA数见表1。

表1 部分物种的miRNA种类数
2 miRNA的特征
miRNA一般具有以下几个特征:①长度通常在21~26nt;②是内源性、非编码的小RNA分子,不具有开放阅读框;……
