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太湖流域中华鳖不同群体线粒体基因序列比较分析

2017-08-14韩晓磊徐棉棉沙永良徐建荣韩曜平

常熟理工学院学报 2017年4期

韩晓磊,顾 益,徐棉棉,沙永良,徐建荣,韩曜平

(1.常熟理工学院 生物与食品工程学院,江苏 常熟 215500;2.太仓市西湖川水产专业合作社,江苏 太仓 215400)

太湖流域中华鳖不同群体线粒体基因序列比较分析

韩晓磊1,顾 益2,徐棉棉1,沙永良2,徐建荣1,韩曜平1

(1.常熟理工学院 生物与食品工程学院,江苏 常熟 215500;2.太仓市西湖川水产专业合作社,江苏 太仓 215400)

通过PCR扩增和测序技术对太湖流域的中华鳖太湖花鳖群体和太湖鳖群体的部分线粒体基因序列,包括16S rRNA、12S rRNA、细胞色素b(Cytb)和D-loop区进行比对分析研究. 结果显示:中华鳖太湖花鳖群体和太湖鳖群体的16S rRNA、12S rRNA、Cytb和D-loop区部分基因序列比对相似度和遗传距离分别为97.33%,98.19%,97.34%,98.83%和0.023,0.026,0.026,0.022.结果表明:中华鳖太湖花鳖群体和太湖鳖群体亲缘关系较近,没有达到种间差异,但两者已经出现了一定程度的遗传分化,达到亚种分化水平.

中华鳖;16S rRNA;12S rRNA;细胞色素b;D-loop区

线粒体DNA是共价闭合的双链DNA分子,核酸组成和序列较保守,基因排列的顺序稳定而紧密,无单拷贝和重组. 由于线粒体DNA含有丰富的进化信息,具有长度短、含量丰富、母性遗传和进化速度快等特点,已成为研究动物遗传分化及起源进化的理想手段[1-5]. 中华鳖(Pelodiscus sinensis),隶属于爬行纲(Reptilia)、龟鳖目(Testudoformes)、鳖科(Trionychidae),俗称甲鱼、团鱼、王八等. 在我国,中华鳖分布广泛,除西藏和青海外的其他各省均有发现,长江流域和华南地区分布较多,太湖流域产量历年稳居全国前列[6-7]. 中华鳖太湖群体除普通中华鳖群体,即太湖鳖群体之外,还存在中华鳖地方特色……

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