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我国沈阳一起GII.17型诺如病毒胃肠炎暴发的分子病原学特征研究

2017-07-24王冰张春青王萍张眉眉连志勇

中华实验和临床病毒学杂志 2017年3期
关键词:疫情检测

王冰 张春青 王萍 张眉眉 连志勇

110031 沈阳市疾病预防控制中心(王冰、张春青、王萍、连志勇);110005 沈阳,辽宁省疾病预防控制中心(张眉眉)

·论著·

我国沈阳一起GII.17型诺如病毒胃肠炎暴发的分子病原学特征研究

王冰 张春青 王萍 张眉眉 连志勇

110031 沈阳市疾病预防控制中心(王冰、张春青、王萍、连志勇);110005 沈阳,辽宁省疾病预防控制中心(张眉眉)

目的 明确沈阳地区一起学校急性胃肠炎暴发的病原和基因特征。方法 采集2015年12月沈阳地区某高校暴发疫情中的学生和食堂从业人员病例肛拭子标本共计15份,采用荧光定量RT-PCR进行诺如病毒检测,并对阳性标本进一步进行传统RT-PCR方法扩增、序列测定和系统进化分析。结果 荧光定量RT-PCR检测确定12份标本为诺如病毒阳性,系统进化分析表明,12个毒株均为GII.17基因型,与引起我国2014—2015年流行的GII.17新变异株KR020503株同源性为99%以上。结论 引起我国2014—2015年流行的GII.17新变异株是引起此高校急性胃肠炎暴发的病原,并且GII.17型诺如病毒为东北地区首次检出。

Fund programs: National Science and Technology Major Project of China(2012ZX10004209)

诺如病毒(Norovirus,NoV)属于杯状病毒科诺如病毒属,目前被认为是引起全球冬季急性胃肠炎暴发的最主要病原[1]。NoV为单股正链无包膜RNA病毒,基因组约为7.5 Kb,共有三个开放阅读框(Open reading frams, ORFs),根据ORF1编码的RNA聚合酶区(RNA dependent RNA polymerase, RdRp)和ORF2编码的衣壳蛋白区(Capsid)核苷酸序列差异,将NoV分为5个基因组(GI-GV),其中GI、GII、GIV可感染人类,又以GII型多见[2]。自1995年以来,GII.4基因型一直是NoV引起全球暴发流行的优势株,我国从2006年开始建立病毒性腹泻监测网络,监测结果显示我国NoV引起的胃肠炎暴发型别多以GII.4/2006b变异株为主(占88.2%)[3],这与其他国家报道基本一致。……

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