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TP-M13-SSR技术在枸杞遗传多样性研究中的应用

2017-07-18樊云芳赵建华李彦龙王亚军曹有龙

西北农业学报 2017年6期
关键词:资源检测

樊云芳,尹 跃,安 巍,赵建华,李彦龙,王亚军,曹有龙

(宁夏农林科学院 国家枸杞工程技术研究中心,银川 750002)

TP-M13-SSR技术在枸杞遗传多样性研究中的应用

樊云芳,尹 跃,安 巍,赵建华,李彦龙,王亚军,曹有龙

(宁夏农林科学院 国家枸杞工程技术研究中心,银川 750002)

利用在SSR扩增产物检测过程中的一种基于荧光测序技术的高通量低成本分析技术体系TP-M13-SSR对29份枸杞种质资源进行遗传多样性研究。13对引物共检测到78个等位基因,平均每个位点6个等位基因。群体平均的主等位基因频率(MAF)、有效等位基因数(NE)、观测杂合度(HO)、期望杂合度(HE)、Shannon’s信息指数(I)和多态信息含量(PIC)分别为0.625、2.684、0.401、0.514、1.103和0.487。聚类分析表明:29份枸杞种质间相似系数为0.66~0.97,平均相似系数为0.81;供试材料可分为5大类7亚类。研究表明,供试材料的遗传相似性较高,遗传多样性较低。TP-M13-SSR方法具有经济、灵敏、高效等优点,在枸杞遗传多样性研究中应用效果好。

枸杞;TP-M13-SSR;遗传多样性

枸杞(LyciumbararumL.)系茄科(Solanaceae)枸杞属(LyciumL.),全球约有80余种,主要分布在南美洲南部、北美洲南部、非洲南部和欧亚大陆[1]。中国枸杞属有7个种3个变种,宁夏枸杞和中国枸杞分布最广泛,宁夏枸杞主要分布在中国西北地区,中国枸杞主要分布在中国华中、西南和东南地区[2]。枸杞种质资源研究始于20世纪50年代,细胞学、形态学、同工酶等方面的研究都在种质资源鉴定和亲缘关系研究中起积极作用[3-4]。分子标记(RAPD、AFLP、SSR)等技术发展,为种质资源研究提供了一条准确、高效、快捷的途径,近年来也被逐渐应用到枸杞种质资源的上述研究中[5-8],SSR标记具有高多态性、重复性、稳定性等优点,广泛应用于植物种质资源鉴定及亲缘关系等方面研究中。……

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