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甘蔗TAD1(ScTAD1)的克隆与表达分析

2017-06-05李旭娟字秋艳李纯佳刘洪博林秀琴徐超华陆鑫毛钧刘新龙

中国农业科学 2017年9期
关键词:植物分析

李旭娟,字秋艳,李纯佳,刘洪博,林秀琴,徐超华,陆鑫,毛钧,刘新龙

(云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室,云南开远 661699)

甘蔗TAD1(ScTAD1)的克隆与表达分析

李旭娟,字秋艳,李纯佳,刘洪博,林秀琴,徐超华,陆鑫,毛钧,刘新龙

(云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室,云南开远 661699)

【目的】Tillering and Dwarf 1(TAD1)是植物株型发育的重要调控基因,该基因与腋芽的形成发育密切相关。获得甘蔗TAD1(ScTAD1)并预测其结构和功能,分析其在甘蔗不同组织部位、不同发育阶段腋芽中及在用生长素(IAA)和细胞分裂素(6-BA)处理后的蔗苗非伸长茎梢部的表达情况,以期为ScTAD1的功能分析及其在甘蔗产量分子辅助育种中的利用奠定理论基础。【方法】采用电子克隆技术并结合反转录 PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR),cDNA末端快速扩增(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)等技术获得ScTAD1的cDNA全长,然后利用生物信息学方法对其序列结构、功能、同源性进行分析;再使用实时荧光定量PCR(real-time fluorescent quantitative PCR,qPCR)技术对该基因在甘蔗品种ROC22不同组织部位(根、茎、叶、分蘖芽、叶鞘、生长点)、茎尖生长点和不同发育阶段腋芽(幼嫩腋芽、半大腋芽、较大腋芽、成熟休眠腋芽)及叶片分别喷施IAA和6-BA不同时间点幼苗非伸长茎梢部的表达特征进行分析。【结果】获得ScTAD1的cDNA全长(GenBank登录号为KX611166),序列分析发现其包含1个1 560 bp的完整开放阅读框,编码519个氨基酸残基,其编码蛋白分子量为55.57 kD,理论等电点pI为9.16。保守结构域分析表明ScTAD1包含7个WD40重复序列的保守结构域;信号肽预测结果表明 ScTAD1蛋白不存在信号肽,为非分泌蛋白;三……

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