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基于差异蛋白质组学解析紫色杆菌素抑制结肠癌细胞HT29的作用机制

2017-06-05刘鹭芦晶王莹逄晓阳许嫚张书文吕加平

中国农业科学 2017年9期
关键词:剂量差异分析

刘鹭,芦晶,王莹,逄晓阳,许嫚,张书文,吕加平

(中国农业科学院农产品加工研究所/农业部农产品加工与质量控制重点开放实验室,北京 100193)

基于差异蛋白质组学解析紫色杆菌素抑制结肠癌细胞HT29的作用机制

刘鹭,芦晶,王莹,逄晓阳,许嫚,张书文,吕加平

(中国农业科学院农产品加工研究所/农业部农产品加工与质量控制重点开放实验室,北京 100193)

【目的】对紫色杆菌素作用后的结肠癌细胞HT29进行差异蛋白质组学分析,探究其影响的代谢通路,揭示其抑制癌细胞生长的作用机制,为新型抗癌药物的开发提供一定的参考。【方法】以不同剂量的紫色杆菌素处理HT29 24、48、72 h,通过MTT试验以及透射电镜分析其对结肠癌细胞的有效抑制剂量及抑制情况。在此基础上,对提取的3个处理组的蛋白进行同位素标记,利用反相液相色谱(RP-LC)联用串联质谱(AB SCIEX Triple TOF 5600)获得样品中的多肽及其相对丰度信息,通过数据库(NCBI. Human. protein database)搜索比对,鉴定差异表达蛋白。利用GO分析、KEGG信号通路分析,解析紫色杆菌素抑癌作用代谢途径。【结果】紫色杆菌素对HT29的抑制作用呈一定的时间、剂量依赖性。当紫色杆菌素对HT29的抑制率达50%时,仅为阳性药物5-Fu剂量的1/6,具有更明显的抑制效果。电镜下观察显示,随着紫色杆菌素剂量增大,细胞内部线粒体出现空泡结构,质膜出泡;当浓度达30 mg·L-1时,细胞膜消失,染色质边集。通过差异蛋白质组学分析,共鉴定出4 258个蛋白,表达差异在2倍以上的蛋白共为757个。其中高剂量组处理差异蛋白数为492个,低剂量组处理的差异蛋白数为112个,阳性对照组差异蛋白数为336个。……

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