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不同地理群体三疣梭子蟹mtDNA本底甲基化水平分析

2017-06-01闻奋亮王银海赖晓芳阎斌伦

海洋渔业 2017年2期

闻奋亮,王银海,赵 莲,赖晓芳,2,3,阎斌伦,2,3,高 焕,2,3

(1.淮海工学院海洋生命与水产学院,江苏省海洋生物技术重点实验室,连云港 222005;2. 江苏省海洋资源开发研究院,连云港 222001; 3. 江苏省农业种质资源保护与利用平台,南京 210014)

不同地理群体三疣梭子蟹mtDNA本底甲基化水平分析

闻奋亮1,王银海1,赵 莲1,赖晓芳1,2,3,阎斌伦1,2,3,高 焕1,2,3

(1.淮海工学院海洋生命与水产学院,江苏省海洋生物技术重点实验室,连云港 222005;2. 江苏省海洋资源开发研究院,连云港 222001; 3. 江苏省农业种质资源保护与利用平台,南京 210014)

利用重亚硫酸盐测序法,对适于三疣梭子蟹(Portunustrituberculatus)线粒体基因组甲基化分析的BSP(Bisulfite sequencing PCR)引物进行了筛选,在设计的21对引物中,获得了12对BSP引物。利用这12对引物分析了三疣梭子蟹海州湾群体(江苏连云港)和莱州湾群体(山东东营)线粒体基因组本底甲基化水平,结果表明:海州湾群体不存在甲基化现象,莱州湾群体发现了2个个体在ND2基因(NADH脱氢酶亚基2)位点存在甲基化现象;在存在甲基化的个体中,甲基化类型主要为CHG和CHH类型,还有少量CpG类型。该研究结果说明,莱州湾群体和海州湾群体线粒体基因组本底水平上的甲基化特征存在一定差异,相关研究值得进一步深入探讨。

三疣梭子蟹; 线粒体基因组; 甲基化; 地理群体

表观遗传学阐释了内在遗传物质和环境互作的关系,因不断有新的发现被报道,因此一直是生命科学研究的热点之一[1]。表观遗传的主要机制包括DNA甲基化、核染色质修饰、基因组印记及非编码microRNA变化等[2],其中DNA甲基化是从细菌到高等生物都普遍存在的表观修饰现象[3]。……

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