向 琳，宫美恒，王 苹，尹万忠，杜 波

(吉林大学第一医院 耳鼻咽喉头颈外科，吉林 长春130021)

头颈部鳞状细胞癌相关基因的生物信息学分析

向 琳，宫美恒，王 苹，尹万忠，杜 波*

(吉林大学第一医院 耳鼻咽喉头颈外科，吉林 长春130021)

目的 从基因和分子水平探讨头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma，HNSCC)的发生机制。方法 从GEO数据库下载人HNSCC相关基因芯片数据，使用BRB-Array Tools软件筛选差异表达基因，采用DAVID、 ToppGene、STRING、Cytoscape工具进行生物信息学分析。结果 BRB分析共筛选出263条差异表达基因，其中上调基因134个，下调基因共129个，对其进行生物信息学分析发现COL1A1、MMP9、COL1A2、COL3A1、MMP1等基因调节HNSCC细胞外基质受体相互作用、小细胞肺癌、肿瘤通路等，影响肿瘤的发生发展。结论 利用生物信息学分析能有效挖掘基因芯片内在数据，为进一步探讨HNSCC的发生机制提供理论参考。

头颈部鳞状细胞癌；差异表达基因；基因芯片；生物信息学

(ChinJLabDiagn,2017,21:0381)

头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma，HNSCC)全球每年大约有500,000例新发患者[1]，新发病例死亡率约为20%[2]，尤其是鼻咽癌和下咽癌的死亡率更高[3]。HNSCC给患者及其家庭带来沉重的生活负担[4]。目前，头颈部鳞状细胞癌的分子机制仍不清楚，从基因水平研究HNSCC的发生发展，对其预防和治疗具有重要意义。分子生物技术、多学科评估和准确分期可能在未来诊断和治疗HNSCC方面发挥重要作用[5]。生物信息学是一门交叉学科，通过聚类分析、通路分析等各种方法筛选大规模基因芯片数据，挖掘出潜在的重要分子，理论上探讨疾病的发病机制。本文采用BRB-Array Tools软件筛选HNSCC差异表达基因，联合其他生物信息学分析工具和数据库，从基因和分子水平探讨头颈部鳞状细胞癌的发生机制。……