朱守鸿 赵兰杰 刘永昌李艳军 张新宇 孙 杰

石河子大学农学院 / 新疆生产建设兵团绿洲生态农业重点实验室, 新疆石河子 832003

陆地棉微管结合蛋白CLASP家族基因的鉴定及表达分析

朱守鸿 赵兰杰 刘永昌*李艳军 张新宇 孙 杰

石河子大学农学院 / 新疆生产建设兵团绿洲生态农业重点实验室, 新疆石河子 832003

CLASP蛋白(CLIP-associated protein, CLASP)是一种调节微管结构与功能的微管结合蛋白, 在植物生长发育及形态建成过程中起着至关重要的作用。本研究利用生物信息学的方法, 在陆地棉基因组数据库中鉴定出 6个编码CLASP蛋白的基因。多重序列比对及系统进化树分析表明, 陆地棉CLASPs可分为2个亚家族(I和II), 亚家族I含有HEAT重复结构域和典型的CLASP-N端结构域, 亚家族II只含有CLASP-N端结构域。实时荧光定量PCR结果表明, 6个 CLASPs基因在棉花各组织中均有表达, 但表达模式各不相同, 其中 CotAD_63740 (GenBank登录号为KX881965)和 CotAD_04861 (GenBank登录号为 KX881961)在纤维中优势表达, CotAD_48232 (GenBank登录号为KX881962)、CotAD_48665 (GenBank登录号为 KX881963)、CotAD_55570 (GenBank登录号为 KX881964)和CotAD_68468 (GenBank登录号为KX881966)在茎中优势表达, 表达模式的不同表明CLASPs在棉花不同组织中功能不同。本研究为深入研究棉花CLASPs的功能奠定了基础。

陆地棉; 微管结合蛋白; 微管; 表达分析

在真核生物中, 微管和微管结合蛋白在组织微管阵列和空间上控制细胞的生长和发育[1-3]。目前,已经发现多类微管结合蛋白家族, 这些家族的微管结合蛋白通过多种功能影响微管组织, 包括调节微管动态特性、影响微管之间的相互作用、微管切割和γ-微管蛋白依靠微管分支等[2-5]。

CLASP蛋白是一种调节微管结构与功能的微管结合蛋白[6-12], 能结合微管和细胞质连接蛋白, 由于结合在微管的正端, 也被称为正端示踪蛋白[13-15]。……