彭 振何守朴龚文芳潘兆娥贾银华卢艳丽杜雄明,*

1中国农业科学院棉花研究所 / 棉花生物学国家重点实验室, 河南安阳455000;2四川农业大学玉米研究所, 四川温江 611130

陆地棉幼苗NaCl胁迫下转录因子的转录组学分析

彭 振1,2何守朴1龚文芳1潘兆娥1贾银华1卢艳丽2,*杜雄明1,*

1中国农业科学院棉花研究所 / 棉花生物学国家重点实验室, 河南安阳455000;2四川农业大学玉米研究所, 四川温江 611130

以棉花耐盐种质早熟长绒7号和感盐种质南丹巴地大花为材料, 利用转录组测序(RNA-Seq)技术分析2个种质在200 mmol L–1NaCl胁迫4 h和24 h后幼苗叶片的转录因子家族及转录因子的表达情况。结果表明, 从样本中鉴定出54个转录因子家族的2815个转录因子。盐胁迫4 h后, 长绒7号有249个转录因子基因表达发生变化; 南丹巴地大花中有261个转录因子基因表达发生变化。在胁迫24 h后, 2个种质对盐响应的转录因子数量均剧增。只在耐盐种质长绒7号特异表达的有106个(4 h)和184个(24 h)转录因子基因, 对于2个种质共同表达的转录因子有143个(4 h)和282个(24 h)。通过筛选, 鉴定出26个与耐盐相关的转录因子家族124个转录因子基因, 并采用荧光定量验证转录组数据的准确性。推测高表达的11个转录因子的基因CotAD_66280 (HD-ZIP)、CotAD_47058 (ERF)、CotAD_18472 (G2-like)、CotAD_04289 (C2H2)、CotAD_57763 (HSF)、CotAD_23656 (TCP)、CotAD_02221 (ERF)、CotAD_23975 (WRKY)、CotAD_54036 (MYB)、CotAD_27788 (NAC)和CotAD_23815 (HSF)有可能与陆地棉抗盐性密切相关, 可作为陆地棉耐盐育种的候选基因源。

陆地棉; NaCl胁迫; 转录组分析; 转录因子

Keywords:Upland cotton; NaCl stress; Transcriptome analysis, Transcription factor

近年来, 全球气候变化和土壤盐渍化加重, 可耕地越来越少, 已经成为全球性的生态问题, 人类面临的形势日趋严峻。在我国, 盐碱地面积多达3.6亿公顷, 占全国可利用面积的4.88%, 另有近2.0亿公顷盐碱荒地资源未被开发利用, 这些盐碱地主要分布在华北、西北、东北和东部滨海地带[1]。……