海洋季也蒙毕赤酵母ACP基因的克隆及生物信息学分析
2017-03-08陶永佳薛永常
陶永佳, 李 根, 薛永常
(大连工业大学 生物工程学院,辽宁 大连 116034)
脂肪酸代谢途径是生物体内主要的代谢途径[1],其产物主要被利用作为细胞膜的合成,而一些产物用作群体感应和蛋白转录后修饰[2]。酰基载体蛋白(Acyl carrier protein,ACP)作为脂肪酸合酶(Fatty acid synthases,FAS)的中心组件,能够结合脂肪酸代谢途径中各种脂肪酰基中间体,是不可或缺的辅因子[3-6]。ACP是一个小的、含量丰富、高度保守的载体蛋白,其三级结构由三个平行的α螺旋和一个短的横向的α螺旋组成[7-8],这四个α螺旋束形成一个疏水性的腔,并具有高度的结构适应性,能够容纳不同长度的酰基链,结合酰基中间体,在各种酶的活性位点之间传递[9-11]。ACP结构和功能已经引起广泛的关注,近几年,主要对其三级结构以及功能多样性分析。本实验室前期从海洋浅海淤泥及岩石附着藻类上筛选得到1株高产油脂菌,经鉴定为海洋季也蒙毕赤酵母,本研究通过对该酵母的ACP基因的克隆,利用生物信息学网站和软件对其拟表达蛋白的理化性质、结构进行预测分析,对酰基载体蛋白的功能深入研究具有重要意义。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 菌种来源 海洋季也蒙毕赤酵母(Meyerozymaguilliermondii)T-1,本实验室筛选保藏;大肠埃希菌E.coliDH5α,本实验室保藏。
1.1.2 培养基 酵母为YPD培养基,陈海水配置;大肠埃希菌为LB培养基。
1.1.3 试剂盒 Ezup柱式酵母基因组DNA抽提试剂盒,UNIQ-10 柱式微量琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒,生工生物工程(上海)股份有限公司;T-Vector pMDTM19试剂盒,宝生物工程(大连)有限公司;质粒小提试剂盒,天根生化科技(北京)有限公司。……
