基因芯片技术筛选转SlNAC1基因拟南芥差异表达基因
2017-03-07于静洋李倩倩焦杨李秋莉
生物工程学报 2017年1期
于静洋,李倩倩,焦杨,李秋莉
辽宁师范大学 生命科学学院 辽宁省植物生物技术重点实验室,辽宁 大连 116081
基因芯片技术筛选转SlNAC1基因拟南芥差异表达基因
于静洋,李倩倩,焦杨,李秋莉
辽宁师范大学 生命科学学院 辽宁省植物生物技术重点实验室,辽宁 大连 116081
研究已表明植物特有的一些NAC (NAM, ATAF1/2, CUC2) 转录因子可提高植物抗逆性,利用基因芯片技术筛选转SlNAC1基因拟南芥与野生型拟南芥间差异表达基因,能够为研究转基因拟南芥非生物胁迫抗性相关基因提供依据。结果显示,在转SlNAC1基因拟南芥43 604个基因中有3 046个差异表达2倍以上的基因。对差异表达5倍以上基因经过GO富集度统计学分析表明,细胞组分相关基因占33.05%;分子功能相关基因占33.95%;生物学过程相关基因占33.00%。对差异表达2倍以上基因进行KEGG信号通路分析,结果表明有2 431个基因涉及到88个不同的信号通路。通过筛选获得转基因拟南芥非生物胁迫抗性相关候选基因,为后续研究NAC转录因子的下游基因及其调控网络的构建提供方向和理论支撑。
差异表达,转基因,非生物胁迫抗性,转录因子,GO分析,KEGG
植物在生长过程中不可避免地会受到生物胁迫 (由生物引起,如病菌、虫害等) 或非生物胁迫 (由一系列过度或不足的物理、化学条件变化所引发的不利于植物生长发育的影响因素,如干旱、高温、冷害、冻害等),它们都能影响植物的生长、发育而降低产量。植物根据特定的环境胁迫进化出多种适应性的分子机制 (通过激活或抑制特定靶基因改变其表达量)[1]来响应不同的非生物胁迫。……
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