王凤格，杨扬，易红梅，赵久然，任洁，王璐，葛建镕，江彬，张宪晨，田红丽，侯振华



中国玉米审定品种标准SSR指纹库的构建

王凤格1，杨扬1，易红梅1，赵久然1，任洁1，王璐1，葛建镕1，江彬2，张宪晨2，田红丽1，侯振华1

（1北京市农林科学院玉米研究中心/玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室，北京100097；2北京华生恒业科技有限公司，北京100083）

【目的】对数量庞大的已知玉米品种构建可共享的作物品种标准DNA指纹库。【方法】基于荧光毛细管电泳检测平台和植物品种DNA指纹库管理系统，利用筛选的40对SSR核心引物对3 998份中国玉米审定品种标准样品进行建库，通过多实验室、多检测平台进行建库数据的质量评估。【结果】绘制了40个玉米建库引物的等位基因频率分布图作为每个引物的特征图谱，在建库试验中发挥了相当于参照样品的作用。形成了一套十重荧光毛细管电泳组合，并在SSR指纹分析器中建立了一套系统默认PANEL作为不同实验室建库时的标准PANEL。统计玉米审定品种指纹库构建的试验情况，每份样品具有2—5套原始试验数据及对应的指纹图谱，其中61%的样品做了2组独立试验，33%的样品做了3组独立试验，最终建成的标准指纹库累计缺失和差异位点仅占0.2%，数据完整性达到99.8%。在不同实验室、不同电泳检测平台的评估结果表明，同一荧光电泳检测平台上获得SSR指纹数据一致性高，而不同的电泳检测平台获得的数据存在一定偏差，为实现不同实验室的SSR指纹数据共享，需要统一荧光引物、分析软件及电泳检测平台。……