锦鲫Clock基因表达量分析中的内参基因稳定性比较
2016-12-23彭治桃蒋国民李金龙程小飞房丽娟王晓清丽1
彭治桃,蒋国民,邹 利,李金龙,程小飞,房丽娟,王晓清,刘 丽1,
(1.湖南农业大学 动物科学技术学院,中国 长沙 410128;2.湖南省水产原种场,中国 长沙 410153;3.湖南省水产科学研究所,中国 长沙 410153; 4.中南大学基础医学院,中国 长沙 410012)
锦鲫Clock基因表达量分析中的内参基因稳定性比较
彭治桃1,2,蒋国民3,邹 利3,李金龙3,程小飞3,房丽娟4,王晓清1*,刘 丽1,3*
(1.湖南农业大学 动物科学技术学院,中国 长沙 410128;2.湖南省水产原种场,中国 长沙 410153;3.湖南省水产科学研究所,中国 长沙 410153; 4.中南大学基础医学院,中国 长沙 410012)
为研究锦鲫Clock基因表达量分析中的内参基因稳定性,采用qRT-PCR技术进行实时荧光定量分析,并用Ge Norm 和 Norm Finder软件对5个内参基因(RPL13,GAPDH,18SrRNA,β-actin和RPS29)进行稳定性评估,筛选出不同组织中最适合的内参基因,以准确定量Clock基因的相对表达水平.实验结果表明,5个内参基因中,18SrRNA在锦鲫的肌肉、心脏、肝脏中表达最稳定,β-actin在肠中表达最稳定,RPL13在肾中表达最稳定;根据筛选的内参基因定量Clock基因的相对表达水平发现,Clock基因在锦鲫肌肉中相对表达量最高,其次依次是肝脏、肾、肠,心脏中最低.本研究准确定量Clock基因, 为锦鲫生物钟节律机制的下一步研究奠定了理论基础.
内参基因;qRT-PCR;锦鲫;Ge Norm程序;Norm Finder程序
实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术因具有灵敏度高、重复性好以及定量准确等优点,被广泛用于生物科学的各个研究领域.但这一技术能否准确定量取决于很多因素,如实验材料质量、RNA质量、cDNA第一链合成效率及内参基因的选择[1].其中,选择合适的内参基因对试验数……
