Fst统计法评估KIF1B 基因rs17401966多态性与肝细胞癌风险Meta分析的异质性来源*
2016-12-22苏明宽郭建峰陈宏斌黄建成
苏明宽,郭建峰,陈宏斌,黄建成
(福建医科大学附属闽东医院检验科,福建宁德 355000)
·论 著·
Fst统计法评估KIF1B 基因rs17401966多态性与肝细胞癌风险Meta分析的异质性来源*
苏明宽,郭建峰,陈宏斌,黄建成
(福建医科大学附属闽东医院检验科,福建宁德 355000)
目的 采用Fst统计法评估二分类变量Meta分析的异质性来源。方法 检索Google Scholar、EMBASE、PubMed、ISI Web of Knowledge 和 CNKI数据库,搜集有关KIF1B 基因rs17401966多态性与肝细胞癌风险关系的病例-对照研究。应用Stata 12.0软件进行Meta分析,使用Arlequin 3.5软件分析研究人群间的遗传分化程度。结果 最终纳入5个病例-对照研究,合计12个研究人群。对12个人群的Meta分析结果显示KIF1B 基因rs17401966 G等位基因与HCC风险负相关(OR=0.77,95%CI:0.65~0.93;P=0.005),然而合并结果存在很强的异质性。通过对12个纳入人群进行遗传分化检验,发现Zhang等的5个研究人群与其他研究人群存在不同程度的遗传分化,进而根据Fst值进行适当的亚组分析,把组8和组9异质性检验的I2值降到了25%以下,然而组8和组9的Meta分析结果却不一致。结论 研究显示在对KIF1B 基因rs17401966多态性与肝细胞癌风险进行Meta分析时,通过对纳入人群的遗传分化检验,可以发现Meta分析的异质性来源。
异质性; 多态性; Meta分析; 遗传分化; 肝细胞癌
2010年,Zhang等[1]开展的中国人群乙型肝炎病毒(HBV)感染相关肝细胞癌(HCC)的全基因关联分析(GWAS),发现1p36.22 区域的KIF1B基因单核苷酸多态性rs17401966与HCC风险显著相关,其5个研究人群的联合P值达3.4×10-19。然而,其他学者后继重复研究并没有取得相一致结果,可能由于遗传分化,不同的研究设计,较小的样本量等。Meta 分析是对具有相同研究目的多个医学研究进行综合分析的一系列过程,通过Meta分析,可以达到增加样本量进而增强统计效能。……
