姜芳燕，李 花，尹乐乐，马 军，王辉芳

(1海南热带海洋学院 热带生物与农学院，海南 三亚 572022；2长沙市公安局刑侦支队，湖南 长沙 410004)



鹿角灵芝免疫调节蛋白基因的克隆及生物信息学分析

姜芳燕1，李 花2，尹乐乐1，马 军1，王辉芳1

(1海南热带海洋学院 热带生物与农学院，海南 三亚 572022；2长沙市公安局刑侦支队，湖南 长沙 410004)

采用同源克隆法,从Ganodermaamboinense07基因组中成功PCR扩增到编码FIP-gam的全长基因,并进行测序.通过生物信息学分析,可知FIP-gam基因全长333 bp,编码107个氨基酸,理论分子量为12.0 kDa,等电点为4.4 8.进化树及序列分析结果显示,FIP-gam与灵芝组FIPs同源性较高,而与金针菇、草菇和血红丛赤壳的FIPs同源性较低.采用SWISS-MODEL进行同源建模,结果表明FIP-gam为α-螺旋和β-折叠形成哑铃形的二聚体蛋白.本研究为进一步高效表达FIP-gam及其结构功能关系的研究奠定基础.

Ganodermaamboinense;免疫调节蛋白;基因克隆;生物信息学

0 引言

灵芝(Ganodermasp.)是我国传统药用真菌,含有多糖、三萜类、蛋白类、甾醇、脂肪酸、微量元素等多种营养和药用成分,它们在抗肿瘤、免疫调节、心血管病以及抗菌中发挥着不同的作用[1].近年来,随着生物技术在药物研究和开发中的应用,特别是对中草药中基因、蛋白和药理作用之间关系的逐渐探索,灵芝蛋白质的研究逐渐得到重视[2].真菌免疫调节蛋白(Fungal Immunomodulatory Protein,FIP)是从某些药(食)用真菌中提取的具有与真菌凝集素和免疫球蛋白相类似的结构和免疫调节功能的一类小分子蛋白质[3]. 1989年,Kino等首次从赤芝(G.lucidum)子实体中分离获得FIP,并命名为Ling Zhi-8(LZ-8或FIP-glu)[4].到目前为止,已……