段亚飞, 张 喆, 李吉涛, 李 健, 刘 萍

( 1.中国水产科学研究院 南海水产研究所，农业部南海渔业资源开发利用重点实验室，广东 广州 510300；2. 中国水产科学研究院 黄海水产研究所，农业部海洋渔业可持续发展重点实验室，山东 青岛 266071；3. 青岛海洋科学与技术国家实验室，海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室，山东 青岛 266071 )

脊尾白虾血细胞ESTs的生物信息学与微卫星序列特征分析

段亚飞1, 张 喆1, 李吉涛2, 3, 李 健2, 3, 刘 萍2, 3

( 1.中国水产科学研究院 南海水产研究所，农业部南海渔业资源开发利用重点实验室，广东 广州 510300；2. 中国水产科学研究院 黄海水产研究所，农业部海洋渔业可持续发展重点实验室，山东 青岛 266071；3. 青岛海洋科学与技术国家实验室，海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室，山东 青岛 266071 )

对前期测序得到的脊尾白虾血细胞2853条EST序列进行了生物信息学和微卫星序列特征分析。EST序列拼接得到1053条Unigenes，包括329条Contigs和724条Singlets。BLAST分析表明，593 (56.3%)条Uingenes与数据库中已知基因具有相似性。KEGG代谢途径分析表明，181条Unigenes映射到120条代谢途径。通过EST-SSR分析，共得到416条微卫星序列，检出率为14.58%。其中，两碱基重复序列374条，占89.90%，AG重复类型最多；三碱基35条，占8.41%，AAT重复类型最多；四碱基7条，占1.68%，AAGT重复类型最多。本研究可为脊尾白虾功能基因资源挖掘及分子标记筛选提供有效数据。

脊尾白虾；血细胞；EST；生物信息学；微卫星

脊尾白虾(Exopalaemoncarinicauda)是我国黄、渤海地区重要的经济虾类，具有繁殖能力强、生长速度快和环境适应性强等优点[1-2]。近年来，脊尾白虾养殖产业发展迅速，其遗传育种研究日益受到重视。……