土壤微生物16S rDNA的T-RFLP法医学应用分析
2016-11-21陈尚坤王旭东张晓嘉王佳琦张更谦
陈尚坤王旭东张晓嘉王佳琦张更谦
(1 吉林警察学院 吉林 长春 130117;2 西南政法大学 重庆 401120;3 山西医科大学 山西 太原 030001)
土壤微生物16S rDNA的T-RFLP法医学应用分析
陈尚坤1王旭东2张晓嘉3王佳琦3张更谦3
(1吉林警察学院吉林长春130117;2西南政法大学重庆401120;3山西医科大学山西太原030001)
用T-RFLP法观察不同地域土壤微生物的多态性,为法医学土壤分析提供适当的研究方法。采集自吉林和重庆两地的土壤样本,用PowerSoil®试剂盒提取土壤细菌DNA。PCR扩增16S rDNA基因的多态性区域,引物的5’端采用FAM标记。扩增产物分别用HaeⅢ,AluⅠ内切酶消化后,在3130 Genetic Analyzer电泳分离。采用主成分分析(PCA) 法和主效可加护作用可乘模型(AMMI)进行统计分析。通过采用HaeⅢ酶切后,T-RFLP法可以明确分离重庆和吉林两地的土壤样本;AluⅠ酶切后分离效果稍差。得出T-RFLP法可以区分来自不同地域的土壤样本,为法医学土壤多样性分析提供了可靠的分析方法和结论。
土壤细菌16S rDNA末端-限制性长度多态性主效可加护作用可乘模型
土壤中含有丰富的细菌、真菌、病毒等微生物,其多态性组成深度影响着土壤的性质和环境。土壤微生物在农业,环境分析等领域得到充分的重视和研究。土壤微生物的多态性表现为地域、时间、土壤性质、环境影响等方面。土壤中的众多微生物至今未在实验室成功培养,例如土壤中的细菌有95%~98%未能在实验室成功培养。因此,通过其多态性集中的DNA区域如16S rRNA、18S rRNA基因等去分析土壤的宏基因组。近年来,法医也越来越重视土壤微生物分析[1]。相关的探索领域包括微生物的个体识别,土壤细菌的改变与死亡时间的关系等[2]。……
