五个绵羊群体KAP11-1基因核苷酸序列变异分析
2016-11-16朱建勋王继卿李少斌罗玉柱
朱建勋,王继卿,胡 江,刘 秀,李少斌,闫 伟,罗玉柱
(甘肃农业大学 动物科学技术学院,甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃 兰州 730070)
五个绵羊群体KAP11-1基因核苷酸序列变异分析
朱建勋,王继卿,胡 江,刘 秀,李少斌,闫 伟,罗玉柱
(甘肃农业大学 动物科学技术学院,甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃 兰州 730070)
为了分析绵羊KAP11-1基因的核苷酸序列变异,采用PCR-SSCP方法和DNA测序技术检测了欧拉羊、甘肃高山细毛羊、滩羊、湖羊和青海细毛羊5个群体(749只个体)KAP11-1基因的单核苷酸多态性,同时分析了等位基因频率、遗传杂合度、有效等位基因数和多态信息含量等群体遗传特征。结果表明,5个绵羊群体的KAP11-1基因中共检测到c.93C/T、c.240G/A、c.285C/G/A和c.331A/G 4个单核苷酸多态位点,且c.331A/G为非同义突变。等位基因A在5个群体中出现的频率最高(87.70%),为优势等位基因,其次为等位基因B(基因频率为11.03%),等位基因C和D的频率最低(分别为0.53%和0.74%)。群体遗传学分析结果表明,滩羊KAP11-1基因的遗传杂合度、有效等位基因数和多态信息含量均高于其余4个群体。KAP11-1基因作为羊毛经济性状的主要候选基因之一,其核苷酸序列的变异导致KAP11-1中相应氨基酸的改变,最终可能会影响羊毛纤维的结构和羊毛主要经济性状。
绵羊;KAP11-1基因;核苷酸序列变异;PCR-SSCP;单核苷酸多态性
羊毛纤维的主要结构由角蛋白(Keratins)和角蛋白关联蛋白(Keratin-associated proteins,KAPs)构成。大量的角蛋白聚集成束形成8~10 nm的角蛋白中间丝(Keratin intermediate filaments,KIFs),KAPs则通过大量的二硫键交联形成半刚性基质嵌入到KIFs的半胱氨酸残基中[1]。KAPs最……
