不同非生物胁迫下香樟实时定量PCR内参基因的选择
2016-11-09张佳佳张力维李勇鹏焦晓琳朱逢玲杜丽
张佳佳 张力维 李勇鹏 焦晓琳 朱逢玲 杜丽
(南阳师范学院生命科学与技术学院,南阳 473000)
不同非生物胁迫下香樟实时定量PCR内参基因的选择
张佳佳 张力维 李勇鹏 焦晓琳 朱逢玲 杜丽
(南阳师范学院生命科学与技术学院,南阳 473000)
旨在获得香樟(Cinnamomum camphora L.)在不同非生物胁迫下表达稳定的内参基因,以香樟实生苗为材料,利用实时定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)技术研究分析了两个香樟候选内参基因CcACTc和CcEF1α在不同非生物胁迫下的表达量,并通过BestKeeper软件对CcACTc和CcEF1α的稳定性进行了分析。结果表明,在低温处理中,CcACTc的稳定性较好,在干旱、高盐和ABA处理中则CcEF1α的稳定性较好,并且其在低温处理中也相对稳定。由此可知,CcEF1α更适合作为内参基因应用于香樟非生物胁迫相关基因的定量分析。
香樟;qRT-PCR;内参基因;非生物胁迫
DOI:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.10.025
随着技术的发展,用于基因表达研究的检测方法也越来越多样化,主要包括:实时定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRTPCR)、Northern印迹(northerblot)、DNA微阵列(DNA microarray)和高通量测序(High-throughput sequencing)等[1]。其中,qRT-PCR具有操作方便、灵敏性强、效率高等特点,而且对实验结果有较为准确的分析[2-4],是目前研究基因表达最常用也是最重要的一种手段,在植物基因的研究中有着较为广泛的应用[5,6]。qRT-PCR通过检测样品cDNA中的模板量比较和分析来自不同组织或不同处理的样品中目的基因的表达量,但是其分析结果通常受样品RNA质量、cDNA合成效率以及实验条件的影响,需要内参基因来矫正cDNA样品之间的差异,从而实现对目的基因的定量和标准化,进而得到更加准确、可靠的分析数据[7]。
目前,在……
