利用ISSR分子标记分析辣椒种质资源遗传多样性
2016-10-20刘君李东曾林
刘君 李东 曾林
摘要:运用ISSR标记对8种辣椒进行了遗传多样性的研究。用30条ISSR引物进行筛选,有21条可扩增出清晰可辨条带,而这21条引物在8种材料中共扩增出382个条带,其中270个条带(70.6%)表现出多态性;根据Nei和Li等的遗传相似系数(GS)和遗传距离(GD)对8种材料进行分析,结合SPSS 16.0分析软件进行聚类,构建其遗传相关聚类图谱。
关键词:辣椒;ISSR;分子标记;遗传多样性
中图分类号: S641.303.2 文献标志码: A 文章编号:1002-1302(2016)07-0080-03
辣椒(Capsicum annuum)别名番椒,于明末清初传入我国,至今已有300多年的栽培历史[1]。我国辣椒种植面积有33万~40万hm2,主要分布为福建的小米椒、四川的朝天椒、江南的羊角椒、河南的樱椒、山东的大红椒等。作为在食品烹饪加工中不可缺少的佐料佳品,其味辛香,性温热,有刺激性,同时兼具很高的营养价值,是人们喜爱的蔬菜和调味品,每年产量和经济效益稳居蔬菜作物之首[2-3]。
在真核生物基因组中散步着大量的简单串联重复序列(simple sequence repeat,SSR)[4]。SSR通常为1~4个碱基组成的4~10个或者更多个串联重复单元。简单序列重复区间扩增多态性(inter-simple sequence repeat,ISSR)[5]是在SSR基础上发展起来的一种新的标记技术。其基本原理是在SSR序列的5′或3′端加1~4个锚定碱基,并以此为引物对两侧具有反向排列SSR的一段基因组DNA序列进行扩增。ISSR 是一种快速、可靠的标记技术,具有更好的稳定性和重复性,在植物领域中已经广泛用于重要的农作物如水稻[6]、小麦[7]和棉花[8]等的品系鉴定、遗传作图、基因定位及遗传多样性分析等研究中。当前,ISSR标记亦存在一些缺点,限制了其在某些方面的应用,目前ISSR标记技术主要应用在植物方面,而在动物方面的应用鲜有报道。……
