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山葡萄DFR基因全长cDNA的克隆与序列分析

2016-10-20曹芳芳李娟刘海峰

江苏农业科学 2016年7期

曹芳芳 李娟 刘海峰

摘要:应用RT-PCR和 SMART RACE等技术克隆山葡萄二氢黄酮醇4-还原酶基因的全长cDNA序列,结果表明,该基因全长1 362 bp,包括1 014 bp的完整开放阅读框,推测其编码337个氨基酸。该基因表达产物相对分子质量为37.50 ku,等电点为5.95,是稳定蛋白,不包含信号肽。蛋白质疏水性分析结果表明,DFR疏水性最大值为2.511,最小值为-2.267,平均值为-0.146,整体表现为亲水性。二级结构分析结果表明,DFR的二级结构主要以α-螺旋(35.31%)和不规则卷曲(46.29%)为蛋白最大量的结构元件。对不同植物DFR氨基酸序列进行多重比对发现,同源性较高,DFR与NADPH结合区域和底物结合区域都表现出高度保守。用推导的氨基酸序列与蛋白质数据库进行同源性比较,其氨基酸序列与欧亚种葡萄、大豆、矮牵牛等植物的DFR氨基酸序列两两比对的相似性系数分别为98%、76%、74%。

关键词:山葡萄;二氢黄酮醇4-还原酶;克隆;序列分析

中图分类号: S663.101 文献标志码: A 文章编号:1002-1302(2016)07-0034-05

山葡萄(Vitis amurensis)为葡萄科葡萄属多年生藤本植物,植株似葡萄而细小。山葡萄是葡萄属中最抗寒的一个种,是葡萄属植物抗性育种的珍贵资源,已被多个国家和地区所重视。山葡萄是一种经济价值很高的野生经济植物,成熟后的果实味甜酸,富含果汁,可生食,用山葡萄浆果酿造的葡萄酒品质优良,是我国东北地区葡萄酒工业的主要原料。葡萄酒具有预防心脑血管疾病的作用,原花青素[1]是其中最主要的作用成分。研究表明,原花青素存在较强的抗氧化活性和抗癌活性,对降低毛细血管的渗透性有重要的药理作用。……

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