牦牛GDF9和BMP15基因的克隆、表达分析及miRNA研究
2016-10-13李明霞潘和平阎萍吴晓云王英杰
李明霞潘和平阎萍吴晓云王英杰
(1.西北民族大学生命科学与工程学院,兰州 730070;2.中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,兰州 730050;3.甘肃省牦牛繁育工程重点实验室,兰州 730050)
牦牛GDF9和BMP15基因的克隆、表达分析及miRNA研究
李明霞1,2,3潘和平1阎萍2,3吴晓云2,3王英杰1,2,3
(1.西北民族大学生命科学与工程学院,兰州 730070;2.中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,兰州 730050;3.甘肃省牦牛繁育工程重点实验室,兰州 730050)
以牦牛GDF9和BMP15基因为研究对象,采用PCR方法分别克隆出GDF9和BMP15的两个外显子片段,RT-PCR方法分析了GDF9和BMP15及靶定miRNA在各组织中的表达情况。实验结果显示,克隆扩增获得外显子区进行生物信息学分析。牦牛GDF9基因外显子片段长分别411 bp和1 082 bp,编码453个氨基酸;BMP15基因外显子片段长分别为323 bp和802 bp,编码372个氨基酸。GDF9编码蛋白是亲水蛋白,含有一个信号肽和15个潜在磷酸化位点;BMP15编码蛋白是亲水蛋白,不含信号肽,有6个潜在磷酸化位点。通过实时荧光定量PCR方法分析牦牛GDF9和BMP15基因在不同组织中的表达量,结果表明GDF9在卵巢和子宫中表达相对较高,且卵巢表达显著高于其他组织,心、肾、胰和脾中无表达。BMP15仅在卵巢中表达。TargetScan预测靶定牦牛GDF9和BMP15基因的靶定miRNA,分析GDF9靶基因bta-miR-193a-3p和bta-miR-193b在心、脾、肺、肾和子宫中的表达量,结果显示bta-miR-193a-3p脾中表达量显著高于其他组织,但在心、肺和子宫中均不表达。bta-miR-193b在心和肾中没检测到表达,在肺中的表达量显著低于脾和子宫中。
牦牛;GDF9;BMP15;miRNA
生长转化因子9(Growth differentiation factor 9,GDF9)和骨形态发生蛋白15(Bone morphogenetic protein 15,BMP15)都作为转化生长因子(TGF-β)超家族的成员,参与早期卵泡的生长和分化。……
