云南4处酸性热泉中的变形菌门细菌多样性
2016-09-26宋兆齐刘秀花
宋兆齐,王 莉,刘秀花,梁 峰
(商丘师范学院生命科学学院,河南省高校生物质降解与气化工程技术研究中心,河南 商丘 476000)
云南4处酸性热泉中的变形菌门细菌多样性
宋兆齐,王 莉,刘秀花,梁 峰
(商丘师范学院生命科学学院,河南省高校生物质降解与气化工程技术研究中心,河南 商丘 476000)
选择云南腾冲和龙陵地区的4处酸性热泉(pH:2.3~6.0,温度:47~96 ℃),通过Barcoded pyrosequencing技术及统计学分析,详细阐述了这些样点中变形菌门的物种和遗传多样性。本研究共获得了2 489条变形菌门16S rRNA基因序列,可划分为234个可操作分类单元(OTUs)。分类结果显示,热泉内涵盖了大量已知的目、科和属。而41%的OTUs可能代表了变形菌门的未知物种。系统发育分析显示,样点中存在着若干全新遗传类群,这些样点和美国黄石地区的热泉各自呈现不同的变形菌门遗传多样性。此外,本次调查的热泉彼此间存在着变形菌门群落结构的显著差异。
变形菌门;多样性;系统发育分析;酸性热泉;云南
变形菌门(Proteobacteria)因其内部细菌形态极为多样而得名,该门成员均为革兰氏阴性菌[1],该门包括了 “Alpha”、“Beta”、“Delta”、“Gamma”、“Epsilon”以及近年刚确立的“Zeta”[2]共6个纲。变形菌门广泛分布于各种自然或人工环境下,代表了整个细菌域中最为庞大的一个类群[3],其物种和遗传多样性极为丰富,这决定了该类群涵盖了极为广泛的生理代谢类型。比如,该门中既有好氧菌也存在厌氧菌,既有自养型也有异养型,既存在光能型也存在化能型。因此,变形菌门内的物种在农业、工业、医药、卫生、环保等领域具有重要应用价值,广泛用于氮肥促进利用[4]、植物病虫害防治[5]、工农业废水处理[6]、土壤修复[7]和复杂污染物降解[8]等。……
