张文政，唐继军，李炳志，元英进



酿酒酵母基因组位置效应对外源基因表达的影响

张文政1,2，唐继军2,3，李炳志1,2，元英进1,2

1 天津大学 系统生物学教育部重点实验室，天津 300072 2 天津大学 化工学院 天津化学化工协同创新中心，天津 300072 3 天津大学 计算机与科学技术学院，天津 300072

外源基因元件和模块在底盘细胞中发挥特定功能是合成生物学研究的基本过程，而外源元件和模块在基因组中的位置对其功能的实现具有显著影响。为了系统、全面地表征酿酒酵母基因组位置效应对外源基因的表达影响，以绿色荧光蛋白为报告基因，通过双交换同源重组方法，对酿酒酵母单基因敲除库进行高通量转化，构建酿酒酵母基因组单位点荧光标记菌株库。结合流式细胞术和高通量测序技术对单位点荧光标记库菌株进行分析，构建高表达位点库和低表达位点库，共发现促进绿色荧光蛋白表达的位点428个，抑制绿色荧光蛋白表达的位点444个。通过分析高、低表达位点在酵母染色体上的分布，从全基因组尺度上对酿酒酵母基因组整合位置对基因表达的影响进行表征。本研究可为酿酒酵母基因组位置效应的分布规律和产生机理研究提供重要参考，对外源蛋白工业生产和合成生物学中的基因表达精细调控也具有重要的指导意义。

合成生物学，酿酒酵母，染色体位置效应，外源基因表达

酿酒酵母具有蛋白翻译后修饰功能，适合复杂结构蛋白的表达和功能发挥，被广泛应用于复杂化合物的生产[1-3]。……