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广东地区汉族人群VEGF基因5′端SNP位点遗传多态性

2016-09-12何文智马晓燕冼嘉嘉袁天丽李少英李双琳刘海波广州医科大学附属第三医院法医物证司法鉴定所广东省产科重大疾病重点实验室广东广州510150

法医学杂志 2016年4期

何文智,马晓燕,冼嘉嘉,袁天丽,李少英,李双琳,刘海波,黎 青(广州医科大学附属第三医院法医物证司法鉴定所 广东省产科重大疾病重点实验室,广东 广州 510150)

广东地区汉族人群VEGF基因5′端SNP位点遗传多态性

何文智,马晓燕,冼嘉嘉,袁天丽,李少英,李双琳,刘海波,黎青
(广州医科大学附属第三医院法医物证司法鉴定所 广东省产科重大疾病重点实验室,广东 广州 510150)

目的 调查广东地区汉族人群VEGF基因5′端SNP位点的遗传多态性,为法医学应用及群体遗传学研究提供基础数据。方法 DNA微测序技术SNaPshot分析184例广东地区无关个体VEGF基因5′端4个SNP位点(rs699947、rs1570360、rs833061、rs2010963)的遗传多态性。应用PowerMarker v3.25软件进行统计分析。结果 184例广东地区汉族无关个体VEGF基因5′端4个SNP位点基因分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),每个位点均检出3种基因型。rs833061和rs699947位点紧密连锁。共检出6种单倍型,其中C-G-T-C、C-G-T-G、A-A-C-G、A-G-C-G频率均>10%,为主要单倍型。rs699947、rs833061、rs2010963位点的个人识别率为0.583~0.634,非父排除率为0.133~0.144;4个SNP构成单倍型的个人识别率为0.868,非父排除率为0.438。结论 广东地区汉族人群VEGF基因5′端序列呈现出高度遗传多态性,可作为个人识别和亲权鉴定的遗传学指标,同时可用于相关疾病关联分析。

法医遗传学;多态性,单核苷酸;血管内皮生长因子;汉族

血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)是血管内皮细胞特异性的肝素结合生长因子,可在体内诱导血管新生[1-2]。VEGF属血小板源生长因子超家族,目前主要包括VEGF-A、胎盘生长因子、VEGF-B、VEGF-C、VEGF-D和VEGF-E[3]。VEGF基因位于6p21.3,启动子区及5′非翻译区所在的SNP位点在人群中具有较高的多态性,在肿瘤、不明原因习惯性流产等疾病中被广泛研究[4-5]。……

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