4种解释系统对HIV-1基因型耐药解释相关性评价

2016-08-24赫天一关琪沈阳医学院附属中心医院检验科辽宁沈阳110024

沈阳医学院学报 2016年4期

赫天一，关琪（沈阳医学院附属中心医院检验科，辽宁　沈阳110024）

赫天一，关琪*
（沈阳医学院附属中心医院检验科，辽宁沈阳110024）

目的：比较HIVDB（7.0.1）、ANRS（25_09/2015）、REGA（9.1.0）和HIV GRADE（12/2015）4种解释系统对HIV-1基因型耐药结果解释的一致性。方法：选取我国3种主要HIV-1流行亚型和流行重组模式（B'、CRF01_AE和CRF07_BC），每种选取200条序列，共600条序列。分别用4种解释系统进行耐药结果分析，分为耐药（R）、中度耐药（I）和敏感（S）3个水平。对4种结果进行统计学分析。结果：4种系统基因型耐药解释结果比较相关性较高（r均＞0.57，P均＜0.01）。针对亚型来说，CRF07_BC的解释结果相关性最高，其次为B'亚型，CRF01_AE略低。结论：对于我国主要流行的HIV来说，4种解释系统对11种常用的抗病毒治疗药物耐药结果的解释具有较好的一致性。

HIV-1；基因型耐药解释系统；耐药突变

doi：10.16753/j.cnki.1008-2344.2016.04.004

［Abstract］Objective：To compare the correlation of four drug-resistance interpretation system including HIVDB，ANRS，REGA and HIV GRADE for testing HIV-1 genotype drug resistance.Methods：Trendy subtypes and restructuring model of HIV-1 including B'，CRF01＿AE and CRF07_BC were selected，each genotype was 200 series，600 samples were analyzed by four drug⁃resistance interpretation system，the results were divided into three levels including resistance（R），possible drug⁃resistance （I）and susceptible（S）.Results：Four drug⁃resistance interpretation system had a high correlation in genotypic drug⁃resistance consequence（rs＞0.57，P＜0.01），CRF07_BC had the highest correlation，followed by subtype B，CRF01_AE was slightly lower.Conclusion：Four drug⁃resistance interpretation system has a high correlation in analyzing antiviral drug resistance for major epidemic of HIV in China.

［Key words］HIV-1；genotype resistant interpretation system；drug⁃resistant mutation

基于生物信息学方法建立的基因型耐药分析技术，能够在进行抗病毒治疗之前，对患者基因型进行检测，并结合分析结果制定最优的抗病毒治疗方案，它不仅能够降低由耐药性导致的治疗失败，甚至有可能决定抗病毒治疗的成败，因而在HIV-1抗病毒治疗中起到非常重要的作用，本文比较了4种最为常用的基因型耐药解释系统HIV DB、ANRS、REGA和HIV GRADE，针对我国主要流行的3种HIV-1病毒亚型解释结果上的异同，以期筛选出最符合我国国情的基因型耐药解释系统。