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应用CRISPR/Cas9系统靶向切割细胞内乙型肝炎病毒基因组的研究

2016-08-09鲁宇青韩进超丛旭魏来潘孝本

中华实验和临床病毒学杂志 2016年1期
关键词:小鼠检测

鲁宇青 韩进超 丛旭 魏来 潘孝本

100044 北京大学人民医院,北京大学肝病研究所,丙型肝炎和肝病免疫治疗北京市重点实验室



应用CRISPR/Cas9系统靶向切割细胞内乙型肝炎病毒基因组的研究

鲁宇青韩进超丛旭魏来潘孝本

100044 北京大学人民医院,北京大学肝病研究所,丙型肝炎和肝病免疫治疗北京市重点实验室

【摘要】目的应用近年发展的基因编辑技术成簇规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeat, CRISPR)引导的Cas9核酸酶特异性靶向切割HBV DNA基因。方法基于慢病毒载体的lentiCRISPRv2系统,我们设计了3个特异靶向HBV基因组的向导RNA序列(guide RNA, gRNA)。质粒pUC18-HBV1.2和lentiCRISPR-gRNAs共转染HepG2细胞,或lentiCRISPR-gRNAs与相关慢病毒载体转染293T细胞后产生相应慢病毒。用慢病毒处理整合了HBV DNA的HepG2.2.15细胞或者HepDE19细胞系;并用慢病毒处理基于C57BL/6小鼠腺相关病毒HBV复制模型。结果单靶向CRISPR/Cas9切割可以抑制30%~50%病毒蛋白产生。两个或三个靶向切割则显著提高抑制效率,可达70%~90%。以慢病毒体系处理HepG2.2.15或HepDES19细胞时,HepDES19细胞中HBeAg下降幅度约为HepG2.2.15细胞中的3倍。HBV复制小鼠模型在CRISPR/Cas9慢病毒处理后,血清中HBsAg和HBeAg可转为阴性。结论CRISPR/Cas9系统多位点靶向切割可高效清除细胞内基因组,相对于整合于染色体的基因组,游离于细胞核的HBV基因组对此靶向切割系统更加敏感。

【主题词】肝炎,乙型;共价闭合环状DNA;CRISPR/Cas9;基因;抗病毒

Fundprogram:NationalNaturalScienceFoundationofChina(81170386)

乙型肝炎病毒(hepatitisBvirus,HBV)是双链嗜肝DNA病毒,其感染肝细胞后,病毒基因组在HBV核心蛋白介导下进入细胞核,可形成非整合型的微染色体,作为病毒转录和复制模板长期存在,是当前抗病毒治疗停药后复发及耐药发生的关键原因[1,2]。……

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