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北京地区市售牡蛎轮状病毒污染调查

2016-08-09高志勇严寒秋刘白薇霍达李丹地钱海坤陈丽娟王全意

中华实验和临床病毒学杂志 2016年1期
关键词:方法

高志勇 严寒秋 刘白薇 霍达 李丹地 钱海坤 陈丽娟 王全意

100013 北京市疾病预防控制中心食物中毒诊断溯源技术北京市重点实验室(高志勇、严寒秋、刘白薇、霍达、钱海坤、陈丽娟、王全意); 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所(李丹地)



北京地区市售牡蛎轮状病毒污染调查

高志勇严寒秋刘白薇霍达李丹地钱海坤陈丽娟王全意

100013 北京市疾病预防控制中心食物中毒诊断溯源技术北京市重点实验室(高志勇、严寒秋、刘白薇、霍达、钱海坤、陈丽娟、王全意); 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所(李丹地)

【摘要】目的调查北京地区市售牡蛎轮状病毒的污染状况。 方法2014年2月至2015年3月,在北京市某大型水产品批发市场采集,每摊位采5只为一组,共56组280只牡蛎。用3种方法对样品前处理:直接处理法、PEG 8 000沉淀法和蛋白酶K消化-PEG 8 000沉淀法。然后利用荧光RT-PCR检测样品的A组轮状病毒核酸,采用半巢式反转录-聚合酶链反应方法对A组轮状病毒核酸阳性进行G、P基因分型。对阳性毒株的VP7和VP4基因进行扩增和测序, 采用Mega 6.06软件构建进化树,建树方法为最大似然法。结果直接处理法、PEG 8 000沉淀法和蛋白酶K消化-PEG 8 000沉淀法3种前处理方法A组轮状病毒检出率分别为3.57%(2/56)、7.14%(4/56)和5.38% (3/56)。56组样品中8组A组轮状病毒核酸检测阳性,检出率为14.29%,均在秋冬季检出。轮状病毒基因型组合型为G9/P[8](2株)和G9/P[N](6株)。3株轮状病毒VP7基因和1株轮状病毒VP4基因成功测序,进化分析显示与近年来我国流行的G9/P[8]型毒株同源性最高。结论北京地区秋冬季市售部分牡蛎存在轮状病毒污染,有引起食源性疾病的风险。……

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