杧果FPPS基因的鉴定和序列分析
2016-08-06盖江涛党志国陈华蕊陈振玺
盖江涛,朱 敏,党志国,陈华蕊,陈振玺,王 鹏
(中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南 儋州 571737)
杧果FPPS基因的鉴定和序列分析
盖江涛,朱 敏,党志国,陈华蕊,陈振玺,王 鹏
(中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南 儋州 571737)
法尼基焦磷酸合成酶(Farnesyl Pyrophosphate Synthase,FPPS,EC∶2.5.1.1)是倍半萜合成中的一个关键酶,在植物萜类合成过程中有关键作用。以杧果FPPS基因为研究对象,以拟南芥FPPS基因为参考,通过BLAST方法从番木瓜、金钱橘、甜橙、苹果、小果野蕉、桃子、白梨、葡萄、中华猕猴桃、无油樟基因组数据中获得了FPPS基因,共19条FPPS基因序列,对其进行了系统进化分析和生物信息学分析。系统进化结果显示:双子叶植物纲果树与单子叶植物纲果树关系较远,同是双子叶植物纲的果树关系较近,同科果树亲缘关系更近。生物信息学分析结果显示:氨基酸序列中,酸性蛋白占94.7%,稳定性蛋白占84.2%,有信号肽的蛋白占5.3%,有导肽的蛋白占10.5%,所有蛋白均为有明显跨膜现象的亲水性蛋白;所有FPPS基因亚细胞定位于线粒体中,均有蛋白活性位点。
杧果;萜类;法尼基焦磷酸合成酶;系统进化;生物信息学
盖江涛,朱敏,党志国,等.杧果FPPS基因的鉴定和序列分析[J].广东农业科学,2016,43(6):69-75.
植物萜类是植物挥发物的主要组成成分,主要由半萜、单萜、倍半萜、二萜、四萜等组成,这类物质在植物花果香气组成、昆虫诱导、植物防御、生长调控等方面具有重要作用。法尼基焦磷酸合成酶(Farnesyl Pyrophosphate Synthase,FPPS,EC∶2.5.1.1)是倍半萜合成中的一个关键酶,在植物萜类合……
