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大豆GmMYB138A基因的克隆及冷胁迫诱导表达分析

2016-08-06王金宾金东昊黄成成孙浩然李绪彦

广东农业科学 2016年6期
关键词:大豆利用分析

王金宾,金东昊,黄成成,孙浩然,陈 帅,李绪彦

(吉林大学植物科学学院,吉林 长春 130062)

大豆GmMYB138A基因的克隆及冷胁迫诱导表达分析

王金宾,金东昊,黄成成,孙浩然,陈 帅,李绪彦

(吉林大学植物科学学院,吉林 长春 130062)

根据大豆基因组信息,从大豆品种吉林32中克隆了1个转录因子基因,该基因对应大豆基因组中的CDS Glyma02g03020。生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白属于MYB转录因子类型,主要分布在细胞核中;进化树分析将它与1R-MYB蛋白聚为一类,并与大豆MYB138亲缘关系最近,同源性可达96%,将其命名为GmMYB138A;进一步利用qRT-PCR分析GmMYB138A响应冷胁迫的表达模式,结果表明随着胁迫处理时间的延长,该基因表达逐渐增加,并在胁迫24 h达到高峰,提示GmMYB138A可能参与大豆的冷胁迫应答过程。

大豆;GmMYB138A;克隆;冷胁迫;基因表达

王金宾,金东昊,黄成成,等.大豆GmMYB138A基因的克隆及冷胁迫诱导表达分析[J].广东农业科学,2016,43(6):43-48.

MYB蛋白是植物中最大的一类转录因子,广泛存在于真核生物中并发挥着重要的作用[1]。MYB转录因子含有两个重要的功能区域,一个是N端保守MYB结构域,用于结合特定的DNA序列;另一个是C端转录调控区域,用于决定MYB蛋白对基因表达正/负调节作用。MYB结构域通常包含1~3个串联的、不完全重复的R序列(R1、R2和R3),每个重复的R序列含有52个左右的氨基酸,形成3个α螺旋,进而组成具有疏水核心的HTH(螺旋-折叠-螺旋)结构,其中第3 个α螺旋作为识别螺旋,直接与DNA结合并插入到DNA大沟中[2]。在与DNA直接作用过程中,通常是2个识别螺旋协同作用从而结合特定的DNA基序[3]。……

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