改良CTAB法用于水环境中超微型浮游生物总DNA的提取
2016-08-03贺云彦刘科赛侯建军刘细霞李运涛
武汉纺织大学学报 2016年3期
贺云彦,李 诗,刘科赛,侯建军,刘细霞,李运涛
(湖北师范大学 食用野生植物保育与利用湖北省重点实验室,湖北 黄石 435002)
改良CTAB法用于水环境中超微型浮游生物总DNA的提取
贺云彦,李 诗,刘科赛,侯建军,刘细霞,李运涛*
(湖北师范大学 食用野生植物保育与利用湖北省重点实验室,湖北 黄石 435002)
水环境中超微型浮游生物的研究要求有高质量的总DNA。通过对常规的CTAB法进行改良,对提取过程中的几个关键步骤进行优化,包括联合使用CTAB和SDS,利用5×CTAB去除杂质等,建立一种可以高效提取水环境中超微型浮游生物总DNA的方法,并与常规CTAB法以及蛋白酶K法进行比较。改良后的CTAB法提取的DNA的产量、纯度均最高,也最适合后续的实验研究。
水环境;超微型浮游生物;改良CTAB法;DNA提取
近年来,很多学者致力于水环境中的浮游生物研究,其中超微型浮游生物的研究受到越来越多的的重视[1]。研究超微型浮游生物通常采用分子生物学方法,因而获得高质量的总DNA就成了后续研究的重要基础。超微型浮游生物因为粒径小,水样需提前过滤,导致样品起始量少,且样品细胞含有较多的环境杂质,给超微型浮游生物总DNA的提取带来了一定困难[2]。目前虽然已有一些水样及藻类总DNA的提取方法[3] [4],但这些方法不太适用于超微型浮游生物的研究,提取DNA的效果不佳。因此迫切需要一种更简便、高效、经济的提取方法。
1 材料与方法
1.1 材料
先用筛绢过滤除去水样中的泥沙等大型颗粒杂物,再用5μm Isopore滤膜进行初次过滤,然后用GF/F滤膜将初次过滤的水样进行二次过滤。……
登录APP查看全文
