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达乌尔黄鼠线粒体Cyt b 基因序列特征及其系统进化分析

2016-08-02纪维红徐长林苏军虎

草原与草坪 2016年3期
关键词:物种研究

王 静,纪维红,徐长林,苏军虎,3

(1.兰州职业技术学院,甘肃 兰州 730070; 2.甘肃农业大学 草业学院/草业生态系统教育部重点实验室/甘肃省草业工程实验室/中-美草地畜牧业可持续发展研究中心,甘肃 兰州 730070; 3.甘肃农业大学-新西兰梅西大学草地生物多样性研究中心,甘肃 兰州 730070; 4.Institute of Natural and Mathematical Sciences,Massey University,Private Bag 102 904 North Shore Mail Centre 0632,Auckland,New Zealand)



达乌尔黄鼠线粒体Cyt b 基因序列特征及其系统进化分析

王静1,纪维红2,3,4,徐长林2,苏军虎2,3

(1.兰州职业技术学院,甘肃 兰州730070; 2.甘肃农业大学 草业学院/草业生态系统教育部重点实验室/甘肃省草业工程实验室/中-美草地畜牧业可持续发展研究中心,甘肃 兰州730070; 3.甘肃农业大学-新西兰梅西大学草地生物多样性研究中心,甘肃 兰州730070; 4.Institute of Natural and Mathematical Sciences,Massey University,Private Bag 102 904 North Shore Mail Centre 0632,Auckland,New Zealand)

在甘肃省天祝藏族自治县采集12只达乌尔黄鼠(Spermophilusdauricus),PCR产物直接测序获得Cyt b基因1140 bp序列,采用Clustal X 1.84、MEGA 6.0、Dna SP 5.0 等生物信息学软件进行了序列特征和系统地位分析。结果显示,达乌尔黄鼠Cyt b基因含116个多态信息位点,群体中多态位点类型有转换、颠换,Cyt b基因T,C,A,G碱基含量分别为33.7%,25.9%,27.6%,12.9%。基于Kimura双参数的遗传距离显示,属内种间大黄鼠(Spermophilusmajor)与新疆黄鼠(Spermophilusfulvus)间遗传距离最小(0.034),高加索黄鼠(Spermophilusmusicus)与达乌尔黄鼠最大(0.172),达乌尔黄鼠群体内遗传距离为0.140,种群分化较大,基于NJ法构建的系统进化树符合传统分类标准,研究为达乌尔黄鼠Cyt b基因标记的种群遗传学应用提供了参考。

达乌尔黄鼠;线粒体;遗传多样性;Cyt b

达乌尔黄鼠(Spermophilusdauricus)又名草原黄鼠,隶属于啮齿目松鼠科[1],是地栖松鼠类的一种,大多栖息在沙质或半沙质山坡、平原等[2]。其分布范围比较广,多见于我国东北、华北、西北等地区,主要是鼠疫的宿主和农业、牧业、林业等的害鼠之一,对人类卫生健康也有较大的影响。……

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