牦牛和普通牛DRB1 Intron 1-exon 2序列变异分析
2016-07-28田知利罗玉柱李少斌郭淑珍牟永娟
田知利,陈 杰,胡 江,罗玉柱,刘 秀,李少斌,郭淑珍,牟永娟
(1.甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃兰州 730070;2.甘南州畜牧科学研究所,甘肃合作 747000)
牦牛和普通牛DRB1Intron 1-exon 2序列变异分析
田知利1,陈 杰1,胡 江1,罗玉柱1,刘 秀1,李少斌1,郭淑珍2,牟永娟2
(1.甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃兰州 730070;2.甘南州畜牧科学研究所,甘肃合作 747000)
为揭示牦牛抗逆性及抗病育种积累更多的分子遗传学资料,通过检测DRB1基因在牦牛和普通牛群体中的变异,分析该基因检测区域遗传参数。以甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛、大通牦牛和普通牛为研究对象。应用PCR-SSCP方法检测BoLA-DRB1基因第1内含子及第2外显子部分序列多态性。DRB1基因第1内含子区检测到4处SNPs及1处插入/缺失突变,第2外显子区检测到17处SNPs,两区域均表现为高度多态;单倍型连锁分析发现21种intron 1-exon 2单倍型组型且存在单倍型连锁不平衡现象,A-A1、A-B1、B-A1和B-B1单倍型在牦牛和普通牛中频率较高;聚类分析表明,牦牛DRB1基因第2外显子区碱基序列与普通牛及山羊的同源性最高,系统进化情况与它们亲缘关系远近一致。牦牛和普通牛BoLA-DRB1基因第1内含子及第2外显子多态性丰富,可作为牦牛和普通牛BoLADRB1的遗传标记。
牦牛;普通牛;DRB1基因;Intron 1;Exon 2;多态性
主要组织相容性复合体(Major histocompatibility comp lex,MHC),是由紧密连锁的高度多态基因座组成的染色体上的一个遗传区域,其编码产物MHC抗原为一类细胞表面转膜蛋白,在抗原识别与呈递、免疫应答与调控等方面起着非常重要的作用,动物对许多疾病的抗病性均与MHC有关[1]。……
