刘星++胡金凤++王希东

摘要：为了解西瓜食酸菌耐药结节细胞分化（RND）家族外排转运体中膜融合蛋白CusB生物信息学信息，利用相关软件对西瓜食酸菌和其他革兰氏阴性细菌的CusB蛋白进行理化性质分析，同时对西瓜食酸菌CusB蛋白的疏水性、跨膜结构域、磷酸化位点、信号肽及分泌蛋白亚细胞定位、蛋白质二级结构进行预测。结果表明：西瓜食酸菌CusB蛋白理化性质及进化树分析结果与大肠杆菌较为接近，梨火疫病菌、荧光假单胞菌与其他5种细菌遗传距离较远，预测西瓜食酸菌CusB蛋白有1个区域疏水性较高，存在1个近N端的跨膜结构域，且还有多个磷酸化位点，前1～36个氨基酸残基组成了信号肽，分泌蛋白位于周质空间，二级结构含有较多的α-螺旋、无规则卷曲。对CusB蛋白进行生物信息学分析，既丰富了信息学信息，又有助于在其分子水平的研究，同时也为西瓜食酸菌的抗铜性机理研究提供了依据。

关键词：瓜类细菌性果斑病；西瓜食酸菌；RND外排转运体；CusB蛋白；生物信息学分析

中图分类号： S182文献标志码： A文章编号：1002-1302（2016）05-0034-04

瓜类细菌性果斑病（bacterial fruit bloteh，BFB）是一种严重危害葫芦科植物的世界性种传细菌性病害，其病原菌为西瓜食酸菌（Acidovorax citrulli）[1]。自从1965年在美国首次发现西瓜食酸菌以来，世界多国已相继报道该病害的发生[2]。目前在我国主要分布于新疆、内蒙古、山东、陕西、河北、福建、云南、吉林、海南、黑龙江、辽宁、台湾等15个省（市）的西甜瓜种植区[3]，该病害严重影响了葫芦科植物的产量和商品销量，是我国葫芦科作物产业的主要危害因子[4]。……