霍如雪++刘振宁++杨青

摘要：果胶甲酯酶属于碳水化合物酯酶家族CE-8，是调节果胶甲酯化程度的一种普遍存在的酶，是植物细胞壁的主要成分。为深入研究桃PME基因家族的功能，利用生物信息学方法对桃基因组中PME基因家族成员进行鉴定，并对其基因组信息、蛋白生理生化特征、基因结构、保守结构域和系统进化树等方面进行了研究。结果表明：在桃基因组中共鉴定出69个PME基因，可以分为Group Ⅰ、Group Ⅱ两大类，Group Ⅱ又可以进一步分成3个分支；PME基因在桃的8条染色体上呈现不均匀分布，并存在明显的串联重复现象，共发现18个串联重复基因簇，包含47个基因，串联重复是桃PME基因扩增的主要方式。对桃PME基因结构的分析表明，PME基因在进化上存在着一定的保守性；对桃PME蛋白氨基酸序列的多重比对发现了PME蛋白5个典型的保守结构区域；通过MEME软件对桃PME蛋白保守基序的分析发现了12个比较保守的基序。

关键词：桃；果胶甲酯酶；基因家族；生物信息学

中图分类号： S662.101文献标志码： A文章编号：1002-1302（2016）05-0024-07

E-mail：wgq@lcu.edu.cn。果胶是植物细胞初生壁和胞间层的主要成分[1]，果胶的去酯化能够引起植物细胞结构和功能特性的改变，在果实成熟软化、器官脱落和衰老、花粉发育、花粉管生长和抗逆性等方面具有重要作用[2-9]。果胶的去酯化是由果胶甲酯酶（pectin methylesterase，PME，EC 3.1.1.11）催化完成的，果胶甲酯酶广泛存在于所有高等植物以及一些细胞壁降解的微生物如细菌、真菌中[10]。在高等植物中，果胶甲酯酶通常以多种异构体的形式存在，表现出对特定细胞类型的特异性[11]。……