张永军，胡永浩

(1.中农威特生物科技股份有限公司，甘肃兰州 730046；2.甘肃农业大学动物医学院，甘肃兰州 730070)



福建地区2株猪嵴病毒VP1基因的克隆及遗传进化分析

张永军1，胡永浩2*

(1.中农威特生物科技股份有限公司，甘肃兰州 730046；2.甘肃农业大学动物医学院，甘肃兰州 730070)

摘要[目的]调查猪嵴病毒在福建地区腹泻猪群中的流行和变异情况。[方法]根据GenBank中登陆的猪嵴病毒(porcine kobuvirus，PKoV)结构蛋白VP1基因序列设计特异性引物，采用RT-PCR方法从某猪场采集腹泻小肠样品中扩增猪嵴病毒VP1基因，将扩增后的目的片段克隆后进行序列测定。应用生物信息学软件，将获得的2株猪嵴病毒VP1和GenBank的猪嵴病毒株VP1基因序列进行对比分析。[结果]猪嵴病毒CH/FJNP/12L/2015与匈牙利株K-30-HU/2008/HUN(GQ249161)的核苷酸同源性最高，为88.1%，氨基酸同源性为95.3%。 CH/FJNP/12W1/2015与越南株714441/CAOLANH-VH/2012-2-21(KT266058)的核苷酸同源性最高，为88.2%，氨基酸同源性为96.1%，同源重组分析显示，2株毒株均无明显同源重组发生。[结论]频繁的畜禽国际贸易，以及如今便捷的现代化交通工具，人们生活提供方便的同时，也加速了猪嵴病毒毒性的传播。

关键词猪嵴病毒；VP1基因；同源性

嵴病毒属小RNA病毒科嵴病毒属成员，病毒粒子呈球形，无囊膜，直径为27～30 nm。其衣壳呈二十面体，由3种结构蛋白(VP0、VP3和VP1)组成的60个不对称亚单位构成。病毒基因组为单股正链RNA，其标准毒株人爱知病毒(Aichi virus，AiV)、牛嵴病毒(Bovine kobuvirus，BKoV)、猪嵴病毒(Porcine kobuviruses，PKoV)和已公布羊嵴病毒(Sheep kobuvirus，SKoV)、狗嵴病毒(Canine kobuvirus，CKoV)。2007年匈牙利学者最早在猪粪便中检测诺瓦克(Norovirus)和札幌病毒病毒(Sapovirus)时发现了猪嵴病毒(S-1-HUN/2007/Hungary)，并对其全基因组进行生化测序[1]。……