张学勇简莹娜马利青

(1. 青海大学畜牧兽医科学院， 西宁 810016;2. 青海省畜牧兽医科学院，西宁 810016)



三种隐孢子虫钙依赖蛋白激酶的生物信息学分析

张学勇1，2，简莹娜1，2，马利青1，2*

(1. 青海大学畜牧兽医科学院， 西宁 810016;2. 青海省畜牧兽医科学院，西宁 810016)

摘要：对三种隐孢子虫(C. parvum Iowa II、 C. hominis TU502和C. muris RN66)钙依赖蛋白激酶(Calcium-dependent protein kinases, CDPKs)进行生物信息学分析，探索该蛋白的结构并预测其功能，为其基因功能的研究提供一定的理论基础。通过隐孢子虫基因组数据库收集数据，获得三种隐孢子虫CDPKs蛋白的序列信息，通过生物信息学软件进行分析，预测该蛋白的理化性质、翻译后修饰位点、功能域、亚细胞定位、二级结构、亲/疏水性、抗原表位等。隐孢子虫CDPKs的蛋白性质不稳定，理论分子量从59.76 kDa到76.63 kDa，pI值为5.33～6.09，CDPKs不具有跨膜区和信号肽，不是跨膜分泌性蛋白，都具有蛋白激酶C 磷酸化位点、酪氨酸激酶Ⅱ磷酸化位点、酪氨酸激酶磷酸化位点、cAMP和cGMP依赖蛋白激酶磷酸化位点、N-端糖基化位点、N-端肉豆蔻酰化位点和EF-hand钙结合域，二级结构主要以α螺旋和无规卷曲为主；CDPKs主要存在虫体细胞内，均有20多个潜在的抗原表位。在隐孢子虫中，CDPKs蛋白不仅可单独发挥作用，而且还能通过相互结合发挥其生物学效应；同时，CDPKs有望成为候选疫苗及潜在药物靶点。

关键词：隐孢子虫；钙依赖蛋白激酶；生物信息学；蛋白结构；功能预测

隐孢子虫(Cryptosporidiumspp.)是一种呈世界性分布的人兽共患寄生性原虫，已成为世界范围内水源性传播疾病中的重要病原体，它们能感染人、家畜和野生动物，严重威胁着人类和动物的健康及畜牧业的发展[1]。……