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西门塔尔牛HDAC1基因SNP检测及其与屠宰性状的相关性分析

2016-07-13施巧婷石德顺徐照学李湘萍

广东农业科学 2016年2期

杨 颖,施巧婷,陆 江,石德顺,徐照学,李湘萍

(1.广西大学动物科学技术学院,广西 南宁 530004;2.河南省农科院畜牧研究所,河南 郑州 476800;3.湖北医药学院麻醉学研究所/湖北医药学院附属太和医院,湖北 十堰 442000)



西门塔尔牛HDAC1基因SNP检测及其与屠宰性状的相关性分析

杨 颖1,施巧婷2,陆 江3,石德顺1,徐照学2,李湘萍1

(1.广西大学动物科学技术学院,广西 南宁 530004;2.河南省农科院畜牧研究所,河南 郑州 476800;3.湖北医药学院麻醉学研究所/湖北医药学院附属太和医院,湖北 十堰 442000)

摘 要:通过对37头西门塔尔牛第2条染色体上的组蛋白去乙酰化酶1基因(HDAC1)的Intron 4-Intron 5、Intron 10-Intron 11和3′非翻译区进行克隆和序列分析,采用SSCP分析方法和PCR产物直接测序的方法,判定SNP基因型,并分析SNP基因型与屠宰性状的相关性。结果发现,西门塔尔牛的HDAC1基因Intron 4-Intron 5以及3′端非翻译区没有突变位点;在HDAC1基因Intron 10-Intron 11区存在1个突变位点,该突变位点位于测序结果的110 bp处,为A/G突变,其中AG杂合子频率(48.6%)与纯合子GG/AA频率(51.4%)大致相当,但G等位基因频率(62%)远大于A等位基因出现的频率(38%)。经在37头西门塔尔牛屠宰样品中的背膘厚屠宰性状比较,AA基因型个体的背膘厚显著低于GG和AG型个体,提示G等位基因对生长具有正效应。

关键词:西门塔尔牛;组蛋白去乙酰化酶1;单核苷酸多态性;屠宰性状

在肉牛新品系的培育及品种改良试验过程中,合理改善生长环境、饲养条件,可以改善肉牛胴体和肉质性状,提高养牛业的经济效益。但肉牛本身的遗传基因特性同样会对肉牛的生长状况、屠宰性状等产生显著影响,例如基因突变、遗传变异等[1]。……

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