田纯见，罗 琼，高佳卉，林志雄，鱼海琼，刘志玲，陈 茹，吴晓薇

（广东出入境检验检疫局检验检疫技术中心/广东省动植物与食品进出口技术措施研究重点实验室/国家质量监督与检验检疫总局国家禽流感检测重点实验室·广东，广东 广州 510623）



禽流感病毒广东株HA基因BLSOM神经网络分型方法的建立

田纯见，罗 琼，高佳卉，林志雄，鱼海琼，刘志玲，陈 茹，吴晓薇

（广东出入境检验检疫局检验检疫技术中心/广东省动植物与食品进出口技术措施研究重点实验室/国家质量监督与检验检疫总局国家禽流感检测重点实验室·广东，广东 广州 510623）

摘 要：利用25个禽流感病毒及相关流感病毒广东株HA基因序列，建立三、四核苷酸特征基因片段BLSOM神经网络分型方法，对各片段数量进行统计和归一化处理。设计程序由MATLAB函数模拟人脑思维自组织学习，当训练步数为100及以上各毒株能成功聚类。H1、H3、H5、H7和H9亚型主要毒株分别归为一类，其中H3N2和H7N9毒株HA基因聚类图谱高度相似，表明这些毒株起源相同；不同年代H5N1毒株差异较大；H1N1和H9N2各1个毒株聚为一类，表明这两种病毒自然重组变异，为高危毒株筛查和溯源提供参考。

关键词：禽流感病毒；BLSOM；HA基因；神经网络；分型

禽流感除造成养禽业重大经济损失外，据OIE统计H5N1禽流感已经出现668例人类感染，死亡率达到58.83%。目前新发H7N9禽流感继续流行，并出现新的人类病例，使得禽流感防制工作雪上加霜。这归根结底是动物源性流感病毒传播最终适应人类，给公共健康带来极大威胁［1］。……