孙丹，于萌，郑明星，高营，朱育焱

（中国医科大学1.附属第一医院泌尿外科；2.实验动物部，沈阳110001）



hsa⁃miR⁃138的生物信息学分析及分子调控通路预测

孙丹1，于萌2，郑明星1，高营1，朱育焱1

（中国医科大学1.附属第一医院泌尿外科；2.实验动物部，沈阳110001）

摘要目的对hsa-miR-138进行靶基因、功能富集分析（GO分析）、信号通路富集分析及转录因子预测等生物信息学分析，为后续深入研究hsa-miR-138功能提供实验验证的理论基础。方法通过UCSC基因组浏览器、TargetScan、starbase、DAVID及KEGG公共数据库、Chipbase等在线工具分析hsa-miR-138序列，预测hsa-miR-138-1的靶基因，对预测的靶基因进行GO分析和信号通路富集分析，预测hsa-miR-138的可能转录调控因子。结果hsa-miR-138序列在各物种间具有高度保守性。通过对目前文献的检索，发现hsa-miR-138-1的靶基因中既有抑癌基因，也有癌基因。GO分析发现hsa-miR-138-1靶基因主要富集在转录调控、转录、RNA代谢过程的调节、基因表达、生物大分子的合成等方面（P＜0.01），KEGG通路分析提示相关信号通路主要涉及癌症通路、轴突导向、细胞内噬作用、Wnt信号转导、神经营养因子信号转导等重要生理病理过程。应用Chipbase预测出hsamiR-138的19个调控转录因子。结论hsa-miR-138可能参与多种重要的生物学过程，并作为双向调节因子调控肿瘤的生物学行为。

关键词hsa-miR-138；生物信息学；靶基因；信号通路

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微小RNA（microRNA，miRNA）是广泛存在于动植物体内的一类长度约为20～24个核苷酸的具有调控功能的非编码单链小RNA，其种子序列与靶基因的3′UTR结合后，可降解靶mRNA或抑制靶mRNA的翻译，从而负调控靶基因，参与基因转录后水平调控。……