高晓艳 董迎辉 姚韩韩 林志华（浙江万里学院，浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室，宁波 315100）

文蛤HDAC1基因克隆、时空表达及生长相关SNP位点筛查

高晓艳 董迎辉 姚韩韩 林志华
（浙江万里学院，浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室，宁波 315100）

摘要：为探索HDAC1基因在文蛤生长发育中的作用，研究通过已构建的文蛤转录组文库，利用SMART RACE技术扩增得到文蛤HDAC1（Mm-HDAC1）基因的cDNA全长序列，分析了其生物信息学、组织及发育阶段表达特征，并用直接测序法在外显子中筛查生长相关的SNP位点。结果显示，Mm-HDAC1基因的cDNA全长3065 bp，开放阅读框1599 bp，编码532个氨基酸； 氨基酸序列比对发现，文蛤与其他物种同源性为74.3%—78.7%。荧光定量PCR（qRT-PCR）结果表明，Mm-HDAC1基因在文蛤6个组织中均有表达，其中外套膜中的表达量相对最高，并与其他组织间有极显著差异（P<0.01）； 不同发育时期的表达差异结果表明，Mm-HDAC1基因在壳顶幼虫期表达量最高，显著高于其他发育时期（P<0.05）。SNP位点筛查结果表明，在Mm-HDAC1基因的外显子区域发现了19个SNP位点，其中有3个SNP位点（627A>T、924T>C和1266T>C）与文蛤生长相关。

关键词：文蛤； 组蛋白去乙酰化酶1； cDNA； 荧光定量； SNP

组蛋白去乙酰化酶1（Histone deacetylase 1，HDAC1）是HDACs家族中的重要一员，在卵母细胞成熟、胚胎发育、神经系统发生、骨骼分化、心脏发育、表皮分化、干细胞分化等过程中都发挥重要作用［1］。HDAC1是发现的第一个哺乳动物组蛋白脱乙酰化酶，推测其可能是基因转录的关键调节因子［2］，可介导位点特异DNA结合的转录抑制子［3］。在高等脊椎动物中，Sun等［4］纯化并鉴定了鸡HDAC1蛋白，刘峰等［5］、柳小春等［6］证明猪HDAC1基因与生长及胴体性状相关，刘芳等［7］研究表明HDAC1与藏羚羊（Pantholops hodgsonii）的高原适应性可能有关，Pillai等［8］证明HDAC1基因与斑马鱼（Danio rerio）颅面软骨及鱼鳍的形成有关，李慧等［9］证明HDAC1基因在牙鲆（Paralichthys olivaceus）变态前以及变态阶段均有表达。而在……