APP下载

中华大蟾蜍γ-肌动蛋白基因Bbgγ-Actin的克隆与生物信息学分析

2016-06-13刘彦芳王秋爽凌鸿刘东春代英辉王东

生物技术通报 2016年9期

刘彦芳王秋爽凌鸿刘东春代英辉王东

(1. 沈阳药科大学中药学院,沈阳 110016;2. 沈阳药科大学中韩分子生药学研究室,沈阳 110016)

中华大蟾蜍γ-肌动蛋白基因Bbgγ-Actin的克隆与生物信息学分析

刘彦芳1,2王秋爽1,2凌鸿1,2刘东春1,2代英辉1王东1,2

(1. 沈阳药科大学中药学院,沈阳 110016;2. 沈阳药科大学中韩分子生药学研究室,沈阳 110016)

旨在获得中华大蟾蜍肌动蛋白序列全长。以中华大蟾蜍(Bufo bufo gargarizans)耳后腺为材料,提取总RNA,通过转录组高通量测序快速得到中华大蟾蜍肌动蛋白基因(BbgActin)cDNA全长2 055 bp,通过RT-PCR技术对其ORF序列进行验证,并对BbgActin基因进行分析。序列分析表明,BbgActin基因开放阅读框长1 131 bp,编码376个氨基酸。通过BLAST P程序分析,所得序列与GenBank数据库中肌动蛋白基因序列相似度均在89%以上,氨基酸序列的相似性达90%以上。系统进化分析表明,BbgActin与γ-Actin聚为一类,所得中华大蟾蜍肌动蛋白属于γ-Actin。首次获得了中华大蟾蜍γ-Actin cDNA全长序列。

中华大蟾蜍;γ-肌动蛋白;cDNA全长;系统进化

中华大蟾蜍(B. bufo gargarizans)为蟾蜍科蟾蜍属动物,全身皆可入药,如蟾酥、蟾皮、干蟾、蟾蜍头、蟾蜍舌、蟾蜍肝、蟾蜍胆等[1,2]。因其具有重要的药用价值,如治疗恶性肿瘤、心衰、各种感染性疾病、慢性肝炎、骨髓炎、周围性面神经麻痹、止痛麻醉等而备受关注[3-5]。许多研究者正致力于研究有关的药理作用和活性成分,但对中华大蟾蜍重要生理功能的基因研究则报道较少。肌动蛋白(actin)广泛存在于真核生物中,是肌小节和细胞骨架的重要组成成分,在细胞分裂、染色体运动、细胞器运动、胞质流动等几乎所有真核细胞的生理过程中发挥重要作用[6-8]。……

登录APP查看全文