新疆艾比湖湿地博乐河入湖口古菌多样性分析
2016-06-13莫超胡文革郭飏王翠华武菲
莫超 胡文革 郭飏 王翠华 武菲
(石河子大学生命科学学院,石河子 832000)
新疆艾比湖湿地博乐河入湖口古菌多样性分析
莫超 胡文革 郭飏 王翠华 武菲
(石河子大学生命科学学院,石河子 832000)
旨为了解艾比湖湿地土壤中古菌的多样性及其群落结构组成。以艾比湖湿地博乐河入口土壤为样本,首次利用古菌特异性16S rDNA引物构建克隆文库。使用限制性内切酶AfaⅠ和MspⅠ对目的片段进行酶切分型(amplified rDNA restraction analysis,ARDRA),每种谱型随机选取若干阳性克隆子进行测序,序列比对构建古菌16S rDNA系统进化树。结果显示,测序得到的117条序列划分为61个OTUs,通过序列比对及系统发育分析归类为广古菌门(Euryarchaeota)和奇古菌门(Thaumarchaeota)两大门类。广古菌门的盐杆菌科(Halobacteriaceae)为第一优势菌群,包括盐微菌属(Halomicrobium)、盐碱球菌属(Natronococcus)、盐碱团菌属(Halalkalicoccus)等10个属,共48个OTU(78.7%),阳性克隆子77个(63.6%)。艾比湖湿地博乐河入口土壤古菌多样性丰富并存在大量的潜在新种。
艾比湖湿地;古菌多样性;16S rDNA克隆文库;ARDRA
微生物多样性的变化能较早地反映土壤质量变化过程,是评价自然或人为干扰引起的土壤变化的重要指示因子。同时微生物的分布并不是随机的,存在“微生物生物地理地图”[1]。古菌作为一类区别于真细菌和真核生物的第三域生命形式存在[2],随着分子生物学技术的不断发展,人们发现它们在自然界中的分布范围十分广泛。Cytryn与Ochsenreiter等[3,4]发现在盐湖、天然盐场和一些高盐环境中存在着大量古菌,其中广古菌门(Euryarchaeota)的盐杆菌科(Halobacteriaceae)为优势菌群,它们生存的适宜pH范围为6-11。
艾比湖(Ebinur Lake)是新疆第一大咸水湖,它不仅影响着新疆北部地区的生态环境,同时在当地的经济发展中发挥着重要的作用[5]。……
